MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4411314241 · doi:10.1111/febs.70156

Epithelial cell shape changes contribute to regulation of ureteric bud branching morphogenesis

2025· article· en· W4411314241 sur OpenAlexaff
Kristen Kurtzeborn, Vladislav Iaroshenko, Tomáš Zárybnický, Julia Koivula, Heidi Anttonen, O. Mäkelä, Darren Bridgewater, Ramaswamy Krishnan, Ping Chen, Satu Kuure

Notice bibliographique

RevueFEBS Journal · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRenal and related cancers
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesHelsinki Institute of Life Science, Helsingin YliopistoBiotieteiden ja Ympäristön Tutkimuksen ToimikuntaBiocenter FinlandOrionin TutkimussäätiöMunuaissäätiöLasten Syöpäsäätiö VäreenHelsingin Yliopisto
Mots-clésMorphogenesisCell biologyBranching (polymer chemistry)BiologyUreteric budActinCell divisionAnatomyBiophysicsCellKidney developmentChemistryEmbryonic stem cellGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Branching morphogenesis orchestrates organogenesis in many tissues, including the kidney, where ureteric bud (UB) branching determines kidney size and shape and the final nephron number. Molecular regulation of UB branching is rather well studied, whereas the cellular mechanisms and tissue organization during UB arborization are less understood. Here, we characterized epithelial cell morphology in three dimensions (3D), studied mechanisms regulating cell shape changes, and analyzed their contribution to novel branch initiation in normal and branching-incompetent bud tips. Unbiased machine-learning-based segmentation of tip epithelia identified geometrical round-to-elliptical transformation as a key cellular mechanism facilitating growth direction changes to gain optimal branching complexity. Cell shape and molecular analyses in branching-incompetent epithelia demonstrated a distinct failure to condense cell size and modify its conformation. This, together with changes in adhesive forces, defective actin dynamics, and disorganization in myosin-9 (MYH9)-based microtubules, suggests altered biophysical properties in tip cells, where branch point decisions are made and actualized. The data demonstrate that dynamic changes in volume and morphology of individual epithelial cells, together with optimal traction stress, facilitate novel branch formation in the UB tip niche. Based on these results, we propose a model where epithelial cell crowding, in tandem with stretching, transforms individual cells into elliptical and elongated shapes. This creates local curvatures that drive new branch formation during the ampulla-to-asymmetric ampulla transition of the UB.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,026
Score d'incertitude au seuil0,285

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueFEBS JournalMême sujetRenal and related cancersTravaux en français237 207