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Enregistrement W4411358117 · doi:10.1016/j.gimo.2025.103427

Identification and characterization of short-chain dehydrogenase/reductase 3 (DHRS3) deficiency, a retinoic acid embryopathy of humans

2025· article· en· W4411358117 sur OpenAlexaff
Akiko Hashimoto, Jianshi Yu, Christina Williams, Karin Gaudenz, Parisa Varshosaz, Ruonan Zhao, Nageswara Pilli, Tian Liu, Jonathon Russell, Rebecca S Tooze, Stephen R.F. Twigg, Siddharth Banka, Elizabeth Sweeney, Simon J. McGowan, Samantha J L Knight, Jenny C Taylor, Tawfiq Froukh, Irene Valenzuela, Núria Martínez‐Gil, Mar Costa‐Roger, Teresa Villarreal‐Molina, Rami Abou Jamra, Felix Gattermann, Margarete Koch‐Hogrebe, Dagmar Wieczorek, Paul A. Trainor, Alexander R. Moise, Andrew O.M. Wilkie, Maureen A. Kane

Notice bibliographique

RevueGenetics in Medicine Open · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolism and Genetic Disorders
Établissements canadiensNOSM University
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilManchester Biomedical Research CentreNIHR Oxford Biomedical Research CentreUniversity of OxfordNational Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Institute for Health and Care ResearchDepartment of Health and Social CareNational Institutes of HealthCancer Research UKWellcome TrustUniversity of Maryland
Mots-clésRetinoic acidIdentification (biology)BiochemistryChemistryBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Purpose Signaling by the morphogen all-trans retinoic acid (RA) is critical for embryonic development, during which its tissue concentration must be tightly regulated. We investigated 8 sibships (12 individuals) segregating 5 different homozygous variants of dehydrogenase/reductase 3 ( DHRS3 ), which encodes an embryonically expressed enzyme (short-chain dehydrogenase/reductase 3; also termed SDR16C1) that catalyzes the reduction of retinaldehyde to retinol, limiting excessive RA synthesis. Methods We assessed variant pathogenicity using comparative phenotypic and bioinformatic analysis, quantification of DHRS3 expression, and measurement of plasma retinoid metabolites. Results Five homozygotes from 3 families (1 family segregating a deletion of the promoter and 5′-untranslated region of DHRS3 , the other 2 a missense variant p.(Val171Met)), manifested a congruent phenotype, including coronal craniosynostosis, dysmorphic facial features, congenital heart disease (4/5 individuals), and scoliosis (5/5 individuals). Transcription of DHRS3 in whole blood cells from 2 homozygotes for the promoter/5′-untranslated region deletion was 90% to 98% reduced. Cells transfected with a DHRS3-Val171Met construct exhibited reduced retinaldehyde reduction capacity compared with wild-type, yielding reduced retinol and elevated RA; correspondingly, plasma from homozygous patients had significantly reduced retinol and elevated RA (exceeding the normal range), compared with controls and heterozygous relatives. Three additional homozygous missense variants of DHRS3 (p.(Val110Ile), p.(Gly115Asp), and p.(Glu244Gln)) were shown to reduce catalytic activity in vitro and/or in vivo but were associated with normal or different phenotypes that did not meet the threshold to assign likely pathogenicity. Conclusion We define a novel developmental syndrome associated with biallelic hypomorphic variants in DHRS3 ; a careful assessment of individual variants is required to establish a causal link to phenotype.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,069
Score d'incertitude au seuil0,510

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,299
Écart entre enseignants0,286 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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