Chloroplast capture creates cryptic lineages with differential geographic patterns in <i>Arctostaphylos uva-ursi</i> (Ericaceae)
Notice bibliographique
Résumé
Arctostaphylos uva-ursi inhabits circumboreal, alpine, and immediate coastal habitats, while the center of diversity of Arctostaphylos is largely restricted to Mediterranean climates of the California Floristic Province. To discover its relationship to other Arctostaphylos species and to determine whether patterns of variation exist across its circumboreal range, we sampled A. uva-ursi extensively and sequenced ITS and a chloroplast locus, rpl32-trnL. In the cpDNA tree and haplotype network, A. uva-ursi samples appear within two distinct lineages corresponding with different, broad geographic regions, suggesting that one lineage originated via chloroplast capture. Thus, A. uva-ursi contains a phylogenetically typical lineage and a cryptic, chloroplast-captured lineage. Both lineages are widespread, but the lineage with the captured chloroplast is principally on the west coast of North America and dominates our collections from Europe, while the other lineage dominates eastern and northern North America, with some samples in Europe as well. The dominance of the west coast lineage in Europe suggests Beringia as a principal, but not exclusive dispersal path. Reproduction between these two lineages may be responsible for the tetraploid populations found throughout the distribution of the species.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».