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Enregistrement W4411370876 · doi:10.1101/2025.06.11.659204

Selective inhibition of MR1-restricted T cell activation by a novel MR1-targeting nanobody

2025· preprint· en· W4411370876 sur OpenAlexafffund
Timothy Bates, Corinna A. Kulicke, Sintayehu K Gurmessa, Se-Jin Kim, Sushant Suresh, Jules B. Weinstein, Audrey Hinchliff, John E. Burke, David Lewinsohn, Fikadu Tafesse

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueNanoparticle-Based Drug Delivery
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaUniversity of Victoria
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthMichael Smith Health Research BC
Mots-clésCell biologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract MR1 is a non-polymorphic, ubiquitously expressed, MHC class I-like antigen-presenting molecule that presents small-molecule metabolites to T cells. Studies have shown that MR1 plays a role in microbial infection, inflammation, and tumor immunity. The antigens it presents include metabolites of microbial and self-origin as well as small-molecule drugs and form stable complexes with MR1 that are displayed on the cell surface to activate T cells. However, unlike classical MHC I and II molecules, the fundamental biology of MR1 remains poorly understood, particularly the mechanisms governing antigen loading and intracellular trafficking. This knowledge gap is largely due to the lack of molecular tools available to precisely manipulate MR1 function. In this study, we describe a high-affinity (1.6 nM K D ) anti-MR1 nanobody, MR1Nb1. We characterize the binding of this nanobody including affinity by ELISA and kinetics by BLI. Crucially, we map the binding epitope of MR1Nb1 on MR1 by HDX-MS, providing key insights into the mechanism through which it blocks MR1T cell activation. In functional assays MR1Nb1 effectively and specifically blocks MAIT cell activation by cells infected with M. tuberculosis or treated with M. smegmatis supernatant. This nanobody represents a unique and versatile tool for the field, as it can be produced inexpensively and expressed intracellularly within antigen-presenting cells. Hence, our study provides a powerful new molecular probe for dissecting the mechanistic underpinnings of MR1 biology and uncover its broader roles in immunity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,208
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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