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Enregistrement W4411412363 · doi:10.1016/j.xcrp.2025.102659

Cryo-EM structures of artificial spider silk nanofibrils reveal insights into β sheet crystallization

2025· article· en· W4411412363 sur OpenAlexfundno aff
Yiling Zhang, Danni Li, Qinyue Zhao, Wencheng Xia, Yongyi Xu, Yanming Li, Cong Liu, Dan Li, Bin Dai

Notice bibliographique

RevueCell Reports Physical Science · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueSilk-based biomaterials and applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesShanghai Institute of Organic Chemistry, Chinese Academy of SciencesChinese Academy of Sciences, Shanghai BranchScience and Technology Commission of Shanghai MunicipalityNational Natural Science Foundation of ChinaCanadian Anesthesiologists' SocietyChinese Academy of SciencesNational Science Foundation
Mots-clésSpider silkSILKSpiderPolymer scienceCrystallizationMaterials scienceBiologyEngineeringChemical engineeringComposite materialZoology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Spider silk is renowned for its exceptional mechanical properties, including its strength, toughness, and lightweight nature, making it a promising biomaterial. These properties largely arise from β sheet crystalline regions composed of poly(A) sequences, formed via liquid-liquid phase separation (LLPS). However, its nanoscale dimensions and disordered segments complicate structural characterization. In this study, we investigate an artificial spider silk protein, replacing poly(A) motifs with amyloidogenic peptides (GDVIEV) that promote β sheet formation. This replacement facilitates LLPS and the formation of nanofibrils with periodic structures resembling the β sheet conformation of natural spider silk. Using cryoelectron microscopy, we identify three different fibril polymorphs. The GDVIEV peptides predominantly adopt β sheet structures in the nanofibril core, stabilized by hydrogen bonds and hydrophobic interactions. These findings enhance our understanding of the self-assembly mechanisms and structural organization of spider silk, providing valuable insights for the development of biomimetic silk materials and the design of artificial proteins.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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