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Enregistrement W4411509767 · doi:10.1101/2025.06.20.660705

RNF13 is a novel interactor of iduronate 2-sulfatase that modifies its glycosylation and maturation

2025· preprint· en· W4411509767 sur OpenAlexafffund
Valérie C. Cabana, Antoine Y. Bouchard, Audrey M. Sénécal, Laurent Cappadocia, Marc Lussier

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLysosomal Storage Disorders Research
Établissements canadiensUniversité de MontréalUniversité du Québec à Montréal
Organismes subventionnairesCentre d’Excellence en Recherche sur les Maladies Orphelines – Fondation Courtois
Mots-clésUbiquitin ligaseGlycosylationImmunoprecipitationMucopolysaccharidosis type IIBiologyUbiquitinCell biologyHunter syndromeProteasomeHEK 293 cellsDNA ligaseIntracellularBiochemistryComputational biologyGeneEnzyme replacement therapyDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Mucopolysaccharidosis type II, also known as Hunter syndrome, is a rare and fatal disease caused by mutations in the iduronate 2-sulfatase (IDS) encoding gene. The enzymatically inactive variant proteins lead to pathological accumulation of glycosaminoglycans in the lysosomes, causing dysfunction in multiple organs. IDS is expressed as a precursor protein, and its processing and lysosomal targeting are crucial for proper enzymatic activity. However, IDS intracellular dynamic is poorly understood and a better understanding of its processing mechanisms would benefit the development of new therapeutic strategies. AlphaFold 3 predicted an interaction between IDS and the E3 ubiquitin ligase RNF13. Co-immunoprecipitation assays confirm this interaction and further show that RNF13 interacts preferentially with a predominantly underglycosylated immature form of IDS, resulting in altered IDS glycosylation and maturation. The results demonstrate that IDS glycosylation site Asn246 is important for lysosomal targeting, although its glycosylation is not altered by RNF13. This study also unravels that RNF13 forms a heterodimer with the E3 ubiquitin ligase RNF167 that modify both RNF13 and RNF167 lysosomal trafficking. In addition, the heterodimer interacts and alters IDS differently than RNF13 or RNF167 alone. RNF13 catalytic E3 ligase activity is required to generate an underglycosylated form, but not that of RNF167. This study exposes that the proteasome rapidly degrades IDS underglycosylated forms, and RNF13 exerts a protective effect. Overall, this study reveals a novel and dual role of RNF13 on IDS maturation and degradation, providing mechanistic insights into IDS trafficking.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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