Role of the clock gene homolog aha-1 in the circadian system of Caenorhabditis elegans
Notice bibliographique
Résumé
Background Circadian rhythms are endogenous and allow organisms to adapt to external daily rhythms of light, temperature and other environmental factors. Circadian rhythms are regulated by a central clock, which is based on a transcription-translation feedback loop. The AHA-1 protein from Caenorhabditis elegans possesses all conserved domains and shows high homology with the positive elements of the central clock loop, BMAL1 in mammals and CYCLE in Drosophila. Methods We studied the possible involvement of aha-1 in the circadian system of adult C. elegans using a bioluminescence-based circadian transcriptional reporter. We also performed qPCRs experiments to quantify the mRNA levels for the aha-1 gene from bulk RNA extractions from adult worms. Results We observed robust luminescent circadian rhythms driven by the aha-1 promoter. However, aha-1 mRNA levels did not show circadian oscillation under the conditions tested. We also show that a mutation in aha-1 generates a significantly longer endogenous period than the one in control strains, suggesting a role for this gene in the nematode circadian clock. Conclusion The results indicate that the CYCLE/BMAL-1 homolog AHA-1 plays a key role in the generation of circadian rhythms in adult nematodes, mainly by regulating period length. These results suggest that the molecular control of circadian regulation in C. elegans exhibits some similarities to other clock model systems.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».