Exonic Deletion in MAN1B1 and a Missense Substitution in CAPN10 Causes Truncal Obesity, Type 2 Diabetes, Delayed Motor Development and Mild Intellectual Disability
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The Mannosidase Alpha class 1B member 1 (MAN1B1) Gene encodes the endoplasmic reticulum mannosyl-oligosaccharide 1,2-alpha-mannosidase (ERManI) protein, which is thought to be crucial for the degradation of misfolded glycoproteins. Although there were differences in clinical features across individuals, but most patients reported had truncal obesity, facial dysphormaties, and mild to moderate intellectual disability. While the CAPN10 gene encodes cysteine protease calpain-10 is an intracellular protease (calcium-dependent) expressed ubiquitously in several tissues and involved in secretions of pancreatic β-cell insulin, translocating glucose transporter 4 to the cell membrane of adipocytes and thermogenesis. Genetic variants in CAPN10 cause diabetes type II (T2DM), obesity, and mild to moderate intellectual disability. Here, we describe the affected individuals of two different Pakistani families segregating with syndromic disorders showing clinical features of truncal obesity, motor developmental delay, and mild intellectual disability in one of the families while obesity, diabetes, and mildintellectual disability in the other family. Whole exome sequencing and Sanger sequencing led to identification of 22 bp exonic deletion in MAN1B1 (c.1833_1854del; Asp613Alafs*108) and a homozygous missense substitution in CAPN10 (c.136C>G; p.Pro46Ala). Our results not only expand the mutational spectrum of MAN1B1 and CAPN10, but also provide deeper insights by documenting clinical features and genetics findings and would prove to be a valuable addition to genetic diagnostics procedures.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».