<i>Streptococcus suis</i> serotype 5: Emerging zoonotic threat with distinct genomic heterogeneity
Notice bibliographique
Résumé
Streptococcus suis is a significant pig pathogen and an emerging zoonotic agent. Serotype 5 is becoming an increasing concern among pigs and humans with S. suis infection worldwide. This study investigated the population structure, phylogenetic relationship, genomic characteristics, and virulence of serotype 5 population, analyzing 89 isolates, including eight from human cases. The results revealed significant genomic heterogeneity and diverse virulence levels within serotype 5 population. Phylogenetic analysis identified two distinct lineages with notable differences in evolution and genomic traits. Thirty-two representative serotype 5 strains were clustered into four groups: ultra-highly virulent (UV) (n = 1), highly virulent plus (HV+) (n = 4), HV (n = 11), and virulent (V) (n = 16). Virulence levels progressively decreased from the UV group to HV+, HV, and V groups. The UV, HV+, and HV strains induced significantly lethal infection in mice during the early phase of infection. The lethal infection induced by UV and HV+ strains was time-dependent but dose-independent. Ultra-high bacterial loads, excessive pro-inflammatory cytokines, and severe organ damage were responsible for the sudden death of mice infected with UV strain at the early phase of infection. The capacity to establish infection, induce excessive pro-inflammatory cytokine production, and elevate biomarkers associated with organ damage varied significantly among HV+ strains. The V strains demonstrated the capacity to induce delayed lethal infection. These findings emphasized the serious public health risk posed by serotype 5 strains. The valuable information for developing effective prevention and control strategies for S. suis serotype 5 infections was provided.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».