T‐cell differentiation stage block bias confers hypermethylation and mediastinal preference in T‐cell lymphoblastic lymphoma
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: The clinical guideline classifies T-LBL and T-ALL jointly, differentiating them merely by the bone marrow blast cell proportion. However, their distinct clinical manifestations, genetic profiles, and specific pathogenic requirements have prompted us to reevaluate the differences between them. METHODS AND RESULTS: We established the NCH-TALL-LBL cohort, which includes flow cytometry data and somatic mutation data from our center. Additionally, we collected T-LBL samples and implemented single-cell RNA sequencing and single-cell T-cell receptor sequencing. Combining the single-cell RNA sequencing data of T-ALL, expression array data, flow cytometry data, we discovered that malignant T cells in T-LBL are predominantly in the DN- and DP-stage blocking modes (DP cells dominate). This block mode in T-LBL generates signals that drive the development of an immunosuppressive microenvironment and the mediastinum preference. Additionally, E2F2, an active transcription factor in the DP and DN stages, upregulates the expression of UHRF1, resulting in hypermethylation of tumor suppressor genes. Findings from in vivo and in vitro research clearly show that demethylation therapy targeting this mechanism effectively inhibits tumor proliferation in T-LBL. CONCLUSION: From the perspective of differentiation blockage, T-LBL and T-ALL represent different stages of the same disease, and the stage block bias of T-cell contributes to their heterogeneity. KEY POINTS: Malignant T cells in T-LBL are primarily blocked in the DN and DP stages, which contributes to the immunosuppressive TME and mediastinum preference of T-LBL. The active transcription factor E2F2 in the DP and DN stages upregulates UHRF1 expression, leading to the hypermethylation of tumor suppressor genes in T-LBL. Demethylation therapy targeting the hypermethylation of tumor suppressor genes mediated by UHRF1 effectively inhibits tumor proliferation in T-LBL.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».