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Enregistrement W4411779851 · doi:10.1038/s41375-025-02667-7

Disease-specific U1 spliceosomal RNA mutations in mature B-cell neoplasms

2025· article· en· W4411779851 sur OpenAlexaff
Ferran Nadeu, Shimin Shuai, Guillem Clot, Laura K. Hilton, Ander Díaz‐Navarro, Silvia Martín, Romina Royo, Tycho Baumann, Marta Kulis, Irene López‐Oreja, Manuel Cossio, Junyan Lu, Viktor Ljungström, Emma Young, Karla Plevová, Binyamin A. Knisbacher, Ziao Lin, Cynthia K. Hahn, Pablo Bousquets‐Muñoz, Miguel Alcoceba, Marcos González, Enrique Colado, Ángel Ramírez Páyer, Marta Aymerich, María José Terol, Alfredo Rivas‐Delgado, Anna Enjuanes, Sílvia Ruiz-Gaspà, Thomas Chatzikonstantinou, Daniel Hägerstrand, Cecilia Jylhä, Aron Skaftason, Larry Mansouri, Kamila Stránská, Michael Doubek, Ellen J. van Gastel-Mol, Zadie Davis, Renata Walewska, Lydia Scarfò, Livio Trentin, Andrea Visentin, Sameer A. Parikh, Kari G. Rabe, Riccardo Moia, Marine Armand, Davide Rossi, Frédéric Davi, Gianluca Gaïdano, Neil E. Kay, Tait D. Shanafelt, Paolo Ghia, David Oscier, Anton W. Langerak, Sı́lvia Beà, Armando López‐Guillermo, Donna Neuberg, Catherine J. Wu, Gad Getz, Šárka Pospı́šilová, Κώστας Σταματόπουλος, Richard Rosenquist, Wolfgang Huber, Thorsten Zenz, Dolors Colomer, José I. Martín‐Subero, Julio Delgado, Ryan D. Morin, Lincoln Stein, Xosé S. Puente, Elı́as Campo

Notice bibliographique

RevueLeukemia · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChronic Lymphocytic Leukemia Research
Établissements canadiensUniversity of TorontoOntario Institute for Cancer ResearchCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreSimon Fraser University
Organismes subventionnairesAgencia Estatal de InvestigaciónEuropean Regional Development FundAstraZenecaAgència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de RecercaFundación Bancaria Caixa d'Estalvis i Pensions de BarcelonaEusko JaurlaritzaAssociazione Italiana per la Ricerca sul CancroNational Cancer InstituteKnut och Alice Wallenbergs StiftelseSouthern University of Science and TechnologyScience for Life LaboratoryNational Natural Science Foundation of ChinaVetenskapsrådetKarolinska InstitutetInstitució Catalana de Recerca i Estudis AvançatsEuropean CommissionMinisterio de Ciencia e InnovaciónMinisterstvo Zdravotnictví Ceské RepublikyFundación Española de Hematología y HemoterapiaGeneralitat de CatalunyaRadiumhemmets ForskningsfonderCancerfondenEuropean Hematology AssociationAmgenAmerican Association for Cancer ResearchCentres de Recerca de Catalunya
Mots-clésBiologyRNADiseaseGeneticsMutationGeneMedicinePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Recurrent mutations in the third base of U1 spliceosomal RNA responsible for marked splicing and expression abnormalities have been described in chronic lymphocytic leukemia (CLL) and some solid tumors. However, the clinical significance of these mutations in large and independent CLL cohorts as well as their presence in other B-cell neoplasms is unknown. Here we characterized U1 mutations in 1670 CLL and 363 mature B-cell lymphomas. We confirmed that the g.3A>C U1 mutation is found in 3.5% of CLL, which conferred rapid disease progression independently of the main biological and clinical prognostic markers of the disease. Additionally, a recurrent g.9C>T mutation was found in 1.5% of CLL causing downstream splicing alterations and associated with adverse prognosis. We also identified a g.4C>T mutation in 10% of diffuse large B-cell lymphomas of the germinal center subtype and a g.7A>G mutation in 30% of EBV-negative Burkitt lymphomas, both of which altered the splicing pattern of multiple genes. This study reveals novel, recurrent, and tumor-specific U1 mutations in mature B-cell neoplasms with biological and prognostic implications, thus establishing U1 as a novel pan-B-cell malignancy driver gene.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,194
Score d'incertitude au seuil0,993

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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