Meta-Transcriptomic Response to Copper Corrosion in Drinking Water Biofilms
Notice bibliographique
Résumé
Drinking water biofilm ecosystems harbor complex and dynamic prokaryotic and eukaryotic microbial communities. However, little is known about the impact of copper corrosion on microbial community functions in metabolisms and resistance. This study was conducted to evaluate the impact of upstream Cu pipe materials on downstream viable community structures, pathogen populations, and metatranscriptomic responses of the microbial communities in drinking water biofilms. Randomly transcribed cDNA was generated and sequenced from downstream biofilm samples of either unplasticized polyvinylchloride (PVC) or Cu coupons. Diverse viable microbial organisms with enriched pathogen-like organisms and opportunistic pathogens were active in those biofilm samples. Cu-influenced tubing biofilms had a greater upregulation of genes associated with potassium (K) metabolic pathways (i.e., K-homeostasis, K-transporting ATPase, and transcriptional attenuator), and a major component of the cell wall of mycobacteria (mycolic acids) compared to tubing biofilms downstream of PVC. Other upregulated genes on Cu influenced biofilms included those associated with stress responses (various oxidative resistance genes), biofilm formation, and resistance to toxic compounds. Downregulated genes included those associated with membrane proteins responsible for ion interactions with potassium; respiration-electron-donating reactions; RNA metabolism in eukaryotes; nitrogen metabolism; virulence, disease, and defense; and antibiotic resistance genes. When combined with our previous identification of biofilm community differences, our studies reveal how microbial biofilms adapt to Cu plumbing conditions by fine-tuning gene expression, altering metabolic pathways, and optimizing their structural organization. This study offers new insights into how copper pipe materials affect the development and composition of biofilms in premise plumbing. Specifically, it highlights copper's role in inhibiting the growth of many microbes while also contributing to the resistance of some microbes within the drinking water biofilm community.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».