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Enregistrement W4411798838 · doi:10.1371/journal.pone.0327489

Differentiating bacteria by their unique surface interactions

2025· article· en· W4411798838 sur OpenAlexafffund
Nicholas Konstantine Kotoulas, Stephanie Tan, Justin R. Nodwell, M. Cynthia Goh

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Identification and Susceptibility Testing
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMitacs
Mots-clésAcinetobacter baumanniiBacteriaStaphylococcus aureusEnterococcus faecalisMicrobiologyBiofilmBacterial cell structureAntibiotic resistanceBiologyPseudomonas aeruginosaAntibioticsChemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

New, rapid, and accessible approaches to bacterial detection are necessary to help curb the rising impacts of antimicrobial resistance. In this study, we introduce a technique that distinguishes bacteria through their unique surface interactions. By measuring and combining the interaction strengths of a bacterium across a set of chemically defined surfaces, we produced a novel bacterial identifier termed the surface interaction profile (SIP). The interaction strengths of twelve test bacteria across three discrete polyelectrolyte multilayer films (PEMs) were measured, facilitated by introducing each bacterial suspension to individual PEMs in microfluidic channels over a 10-minute interaction period and rinsing to remove bulk and loosely bound bacteria. The remaining surface-bound cells were counted via microscopy and plotted against suspension concentrations to build attachment curves whose slopes were measured as the strength of interaction for a given bacteria-PEM combination. These slopes were collected, per bacterial type, to produce each SIP. SIPs were capable of distinguishing between our pathogenic strains (Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, Enterococcus faecalis, methicillin-resistant Staphylococcus aureus, and vancomycin-intermediate Staphylococcus aureus) by Gram stain and individual species, and each blind test pathogen was successfully identified through SIP comparison. Furthermore, SIPs were also successful at differentiating between select Staphylococcus aureus walKR mutants impacting cell wall metabolism and high-risk antibiotic resistance mutants (MRSA and VISA), highlighting the utility and future diagnostic potential of this technique.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,355

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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Résumé présentoui

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