MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4411844174 · doi:10.1111/imm.70013

Distinct T Cell Receptor Clonotypes in the Sardinian Population Highlight the Role of Mucosal‐Associated Invariant T Cells and Invariant Natural Killer T Cells in Multiple Sclerosis

2025· article· en· W4411844174 sur OpenAlexfundno aff
Jiaxin Shen, Elena Rita Simula, Yisu Liu, Gustavo Sganzerla Martinez, David J. Kelvin, Leonardo A. Sechi

Notice bibliographique

RevueImmunology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueT-cell and B-cell Immunology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMinistero dell'Università e della RicercaResearch Nova ScotiaRegione Autonoma della SardegnaMinistero della SaluteDalhousie UniversityEuropean CommissionCanadian Institutes of Health ResearchLi Ka Shing Foundation
Mots-clésT-cell receptorImmunologyBiologyMultiple sclerosisAntigenPopulationImmune systemT cellPathogenesisMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Multiple sclerosis (MS) is a chronic, autoimmune, inflammatory disease of the central nervous system, driven by T-cell mediated immune responses. Studying T-cell receptor (TCR) clonotypes specific to MS in distinct populations can provide insights into disease mechanisms. The Sardinian population, with its unique genetic background resulting from geographical isolation, presents a high-risk cohort for MS research, offering a valuable context for understanding the disease's pathogenesis. We analysed the frequency of unique TCR clonotypes in peripheral blood samples from Sardinian MS patients and healthy controls, focusing on TCRα and TCRβ CDR3 sequences. Clonotypes were functionally annotated for antigen-specific interactions, and hierarchical analysis was performed to identify shared TCR clonotypes between MS patients and healthy controls. A total of 119 TCRβ and 521 TCRα CDR3 clonotypes were significantly more frequent in MS patients compared to healthy controls (p < 0.05). Several TCR-α clonotypes, such as CAVLDSNYQLIW (a MAIT cell clonotype targeting the BST2 antigen) and CAVNTGNQFYF (cross-reactive to multiple antigens, including CMV p65 and BST2), were identified as specific to MS. Shared clonotype analysis revealed the involvement of mucosal-associated invariant T (MAIT) cells and invariant natural killer T (iNKT) cells in MS pathogenesis. Notably, HCV-specific TCR-α clonotypes (NS3-HCV) were significantly increased in MS patients, suggesting a link between infectious disease-related and autoimmune-related clonotypes. No significant differences were observed for other antigens, such as VP22, p65 and BST2. This study identifies distinct TCR clonotypes associated with MS in the Sardinian population, highlighting the role of MAIT and iNKT cells in the disease's pathogenesis. The findings suggest that HCV-specific TCR repertoires may contribute to the development of MS. These results improve our understanding of T-cell mediated immune mechanisms in MS and offer potential targets for therapeutic intervention, particularly within the Sardinian cohort.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,326
Score d'incertitude au seuil0,996

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,195
Écart entre enseignants0,186 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueImmunologyMême sujetT-cell and B-cell ImmunologyTravaux en français237 207