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Enregistrement W4411954234 · doi:10.1021/acschembio.5c00338

Mediator Kinase Inhibitor Selectivity and Activity in Colorectal Cancer

2025· article· en· W4411954234 sur OpenAlexaff
María Jesús Ortiz-Ruiz, Olajumoke Adeniji-Popoola, Konstantinos Mitsopoulos, Robert te Poele, Rahul S. Samant, Gary Box, Will Court, Alexis de Haven Brandon, Sharon Gowan, Aurélie Mallinger, Toby Roe, Kate Swabey, Melanie Valenti, Bissan Al‐Lazikani, Julian Blagg, Christina Esdar, Kai Schiemann, Dirk Wienke, Suzanne A. Eccles, Paul Workman, Paul A. Clarke

Notice bibliographique

RevueACS Chemical Biology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer-related Molecular Pathways
Établissements canadiensInstitute of Cancer ResearchDiscovery Centre
Organismes subventionnairesCancer Research UKWellcome TrustMerck KGaA
Mots-clésRNA polymerase IIMediatorBiologyKinaseCyclin-dependent kinase 8ChromatinCyclin-dependent kinaseCell biologyTranscription factorGene expressionCancer researchSignal transductionGeneCell cycleBiochemistryPromoter

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

High Resolution Image Download MS PowerPoint Slide The Mediator complex is a regulator of gene expression, influencing chromatin structure and RNA polymerase II-mediated transcription. Its activity is controlled by a protein kinase module, which includes cyclin-dependent kinases 8 and 19, that phosphorylates RNA polymerase II and transcription factors to regulate gene expression. Using orthogonal approaches combining chemical and genetic tools, we demonstrated the selectivity of our small-molecule inhibitors derived from 3,4,5-trisubstituted pyridine and 3-methyl-1 H -pyrazolo[3,4- b ]pyridine chemical series in human colorectal cell culture and tumor xenograft models. The lack of activity of our inhibitors in CDK8/19 double knockout models, with respect to molecular, proliferative, and antitumor end points, revealed their specificity and dependence on these kinases. Using our chemical probes and knockout models, we explored Mediator kinase function in human colorectal cancer cells. Phospho-proteome profiling revealed substrates enriched with transcription and chromatin regulators, while promoter reporter experiments identified transcription factor binding sites, including TCF/LEF and AP1, regulated by Mediator kinases. Additionally, altered phosphorylation of several Mediator subunits suggests a mechanism for the rapid regulation of the Mediator complex. Overall, our results demonstrate that CDK8 and CDK19 play pivotal roles in regulating gene expression associated with oncogene activation and signaling pathways. Further studies are warranted to elucidate their broader cellular roles and regulatory mechanisms. The selective inhibitors validated in this study will provide valuable tools for such mechanistic investigations into Mediator kinase functions and their potential therapeutic exploitation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,038
Score d'incertitude au seuil0,491

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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