Host-Specific Adaptation of <i>Legionella pneumophila</i> to Single and Multiple Hosts
Notice bibliographique
Résumé
Legionella pneumophila is an endosymbiotic bacterial species able to infect and reproduce in various protist and human hosts. Upon entry into human lungs, they may infect lung macrophages, causing Legionnaires' disease (LD), an atypical pneumonia, using similar mechanisms as in their protozoan hosts, despite the 2 hosts being separated by a billion years of evolution. In this study, we used experimental evolution to identify genes conferring host specificity to L. pneumophila. To this end, we passaged L. pneumophila in 2 different hosts-Acanthamoeba castellanii and the human macrophage-like cells U937-separately and by switching between the hosts twice a week for a year. In total, we identified 1,518 mutations present in at least 5% of the population at the time of sampling. Forty-nine mutations were fixed in the 18 populations at the end of the experiment. Two interesting groups of mutations included (i) mutations in 4 different strain-specific genes involved in lipopolysaccharide (LPS) synthesis, found only in the lineages passaged with A. castellanii and (ii) mutations in the gene coding for LerC, a key regulator of protein effector expression, which was independently mutated in 6 lineages grown in presence of the macrophage cells. We propose that the mutations degrading the function of the regulator LerC improve the fitness of L. pneumophila in human-derived cells and that modifications in the LPS are beneficial for growth in A. castellanii. This study is a first step in further investigating determinants of host specificity in L. pneumophila.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».