MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4412011580 · doi:10.1111/tid.70067

Longitudinal Innate and Heterologous Adaptive Immune Responses to SARS‐CoV‐2 JN.1 in Transplant Recipients With Prior Omicron Infection: Limited Neutralization but Robust CD4 <sup>+</sup> T‐Cell Activity

2025· article· en· W4412011580 sur OpenAlexafffund
Victor H. Ferreira, Brandon A. Keith, Faranak Mavandadnejad, S. Marocco, G. Amidpour, Alexandra Kurtesi, Freda Qi, Anne‐Claude Gingras, Victoria Hall, Deepali Kumar, Atul Humar

Notice bibliographique

RevueTransplant Infectious Disease · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteToronto General HospitalUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchGovernment of Ontario
Mots-clésImmunologyImmune systemHeterologousAntibodyMedicineImmunosuppressionAcquired immune systemNeutralizing antibodyInnate immune systemT cellFlow cytometryNeutralizationImmunityPopulationCD8VirologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Solid organ transplant (SOT) recipients are at increased risk for severe COVID-19 and often exhibit reduced vaccine efficacy due to chronic immunosuppression. As new SARS-CoV-2 variants emerge, understanding immune responses following natural infection remains critical for informing protection strategies in this vulnerable population. We conducted a longitudinal study of SOT recipients who had recovered from Omicron BA.1 or BA.2 infection, evaluating immune responses to the JN.1 subvariant at 4-6 weeks and 1 year postinfection. METHODS: Neutralizing antibodies to JN.1 were measured using a pseudovirus neutralization assay, and JN.1-specific T-cell responses were assessed by flow cytometry. Frequencies of bulk T-cells and innate immune cells, identified via flow cytometry, and their correlation with adaptive responses were also analyzed. RESULTS: At 4-6 weeks, 30% of participants had detectable JN.1-neutralizing antibodies, rising to 43% at one year, although titers remained low. In contrast, CD4⁺ T-cell responses were robust and detected in 75%-83% of participants at 4-6 weeks, increasing to 75%-93% by 1 year. CD8⁺ T-cell responses were observed less frequently. Exploratory correlations between innate and bulk T-cell subsets with heterologous adaptive immune responses were investigated but did not reveal statistically significant relationships. CONCLUSION: T-cell responses may help mitigate severe disease following exposure to JN.1-derived variants, which continue to dominate the SARS-CoV-2 landscape.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueTransplant Infectious DiseaseMême sujetSARS-CoV-2 and COVID-19 ResearchTravaux en français237 207