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Enregistrement W4412065783 · doi:10.1101/2025.07.03.663014

Dissecting specialized metabolism in space: A MALDI-MSI atlas of Amaryllidaceae alkaloids in <i>Hippeastrum papilio</i> (Ravenna) Van Scheepen

2025· preprint· en· W4412065783 sur OpenAlexafffund
Nuwan Sameera Liyanage, Natacha Mérindol, Kenneth Munk Pedersen, Christian Janfelt, Isabel Desgagné‐Penix

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueChemical synthesis and alkaloids
Établissements canadiensUniversité du Québec à Trois-Rivières
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research Chairs
Mots-clésRavennaAmaryllidaceaeBotanyBiologyComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Amaryllidoideae produce specific specialized metabolites known as Amaryllidaceae alkaloids (AAs), extensively studied for their significant pharmacological potential. AAs’ spatial distribution and biosynthesis within plant tissues remain poorly understood. This study investigates organ- and tissue-specific localization in Hippeastrum papilio , from precursors to galanthamine and haemanthamine, using matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry imaging. Consistent accumulation of AAs was observed in epidermal and vascular tissues, with leaves exhibiting a uniform distribution across all ages and positions. Bulbs exhibited higher concentrations in the outer-scales and basal-plates, while roots displayed compartmentalized patterns, with galanthamine being uniquely abundant in the vascular bundles. Haemanthamine and galanthamine were detected in high quantities in the leaves’ and bulbs’ mucilage, while precursors were scarce. Multivariate analyses revealed that precursors clustered separately from end-products and were specifically enriched in the middle-scales and apical-leaves of the bulbs. Nonetheless, biosynthetic intermediates were observed in all tissues, indicating widespread AA biosynthesis across all organs. These findings suggest a coordinated metabolic network in H . papilio , which challenges existing hypotheses on organ-specific AA biosynthesis and hints at the transport of end-products. This study refines current models of alkaloid biosynthesis and underscore the value of H. papilio as a promising resource for sustainable production of therapeutic AAs. Highlights MALDI-MSI reveals widespread, tissue-specific alkaloid distribution in Hippeastrum papilio, challenging organ-specific biosynthesis and implicating epidermal and vascular tissues in Amaryllidaceae alkaloid production.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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