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Enregistrement W4412087326 · doi:10.1016/j.xgen.2025.100926

Landscape and m6A post-transcriptional regulation of soybean proteome

2025· article· en· W4412087326 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueCell Genomics · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensBiotechnology Research Institute
Organismes subventionnairesNational Science and Technology Major ProjectChina Agricultural Research SystemMinistry of Agriculture and Rural Affairs of the People's Republic of ChinaTaishan Scholar Project of Shandong ProvinceCentral Public-interest Scientific Institution Basal Research Fund, Chinese Academy of Fishery SciencesNatural Science Foundation of Shandong ProvinceNational Key Research and Development Program of ChinaChinese Academy of Agricultural SciencesNatural Science Foundation of Hebei ProvinceNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésProteomeComputational biologyBiologyCell biologyBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The soybean is a critical source of vegetable protein, but its proteome remains undercharacterized. Here, we quantify 12,855 proteins across 14 soybean organs using 4D data-independent acquisition mass spectrometry (4D-DIA-MS), creating the most extensive soybean proteome dataset to date. Organ-specific protein expression and co-expression analyses highlight functional specificity with significant differences in protein-transcript abundance across organs. We also map N 6 -methyladenosine (m 6 A) modifications, identifying their key role in post-transcriptional protein regulation. Integrative analysis of the proteome and m 6 A methylome identifies a novel regulator in m 6 A methylation. This comprehensive proteomic and m 6 A landscape advances our understanding of soybean biology and provides a valuable resource for crop improvement.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,120
Score d'incertitude au seuil0,193

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,206
Écart entre enseignants0,202 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle