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Enregistrement W4412100925 · doi:10.1101/2025.07.07.663436

Supplementation with effective microorganisms in earthen ponds affects common carp growth but not overall microbial communities

2025· preprint· en· W4412100925 sur OpenAlexaff
Michalina Jakimowicz, Katarzyna Sidorczuk, David Huyben, Falk Hildebrand, Łukasz Napora-Rutkowski, Piotr Hajduk, Marek Sztuka, Magda Mielczarek, Dawid Słomian, Urszula Szulc, Joanna Szyda

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEnvironmental DNA in Biodiversity Studies
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesHorizon 2020 Framework ProgrammeQuadram Institute BioscienceNarodowym Centrum Nauki
Mots-clésMicroorganismCarpBiologyEnvironmental scienceEcologyFisheryBacteriaFish <Actinopterygii>

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Probiotics are increasingly explored in aquaculture to enhance fish health and growth without leaving harmful residues. However, their efficacy in real-world pond environments remains poorly understood. Here, we conducted a 103-day field experiment to assess the effects of two effective microorganisms commercial products supplementations on microbial communities and growth performance of common carp ( Cyprinus carpio ). Effective microorganisms were added both to feed and directly to pond water. Microbial diversity was analysed using 16S rRNA and whole-genome shotgun sequencing across three environments – water (three time points), sediment (two time points) and fish intestine (one time point) – from 25 experimental ponds. Bioinformatics processing involved QIIME2 and MG-TK pipeline with taxonomic classification based on the SILVA database. The results showed that although supplemented bacterial families did not establish significantly in pond environments, fish exposed to specific effective microorganisms treatments exhibited improved growth metrics. These findings suggest that effective microorganisms can enhance carp growth in aquaculture without significantly altering resident microbial communities, offering a promising residue-free alternative to traditional additives.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,191
Écart entre enseignants0,184 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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