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Enregistrement W4412107782 · doi:10.1016/j.ebiom.2025.105830

GWAS meta-analysis identifies five susceptibility loci for endometrial cancer

2025· article· en· W4412107782 sur OpenAlexafffund
Dhanya Ramachandran, Xue Min Wang, Triin Laisk, Ying Zheng, Nathan Ingold, Daffodil M. Canson, Pik Fang Kho, Carly J. Chapman, Kristine Bousset, Peter Schürmann, Britta Wieland, Patricia Hanel, Fabienne Hülse, Norman Häfner, Ingo B. Runnebaum, Natalia Dubrowinskaja, Nurzhan Turmanov, Tatyana Yugay, Zura Yessimsiitova, Frédéric Amant, Daniela Annibali, Matthias W. Beckmann, Clara Bodelón, Daniel D. Buchanan, Chu Chen, Megan A. Clarke, Linda S. Cook, Immaculata De Vivo, Wout De Wispelaere, Mengmeng Du, Douglas F. Easton, Julius Emons, Peter A. Fasching, Christine M. Friedenreich, Grace Gallagher, Graham G. Giles, Ellen L. Goode, Holly R. Harris, David J. Hunter, David L. Kolin, Peter Kraft, James V. Lacey, Diether Lambrechts, Lingeng Lu, George L. Mutter, Jeffin Naduparambil, Kelli O’Connell, Alpa V Patel, Paul D.P. Pharoah, Timothy R. Rebbeck, Fulvio Ricceri, Harvey A. Risch, Matthias Ruebner, Carlotta Sacerdote, V. Wendy Setiawan, Xiao-Ou Shu, Melissa C. Southey, Emma Tham, Ian Tomlinson, Constance Turman, Nicolas Wentzensen, Wanghong Xu, Herbert Yu, Wei Zheng, Amanda B. Spurdle, Yosef Yarden, Reedik Mägi, Peter Hillemanns, Dylan M. Glubb, Thilo Dörk, Tracy A. O’Mara

Notice bibliographique

RevueEBioMedicine · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensAlberta Health ServicesUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesEstonian Research Competency CouncilCancer Council VictoriaEuropean Research CouncilMedical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchMedizinischen Hochschule HannoverGenome CanadaUniversity of MelbourneVicHealthNational Cancer InstituteSeventh Framework ProgrammeEesti TeadusagentuurNational Health and Medical Research CouncilAustralian Institute of Health and Welfare, Australian GovernmentCancer Research UKAustralian GovernmentCenters for Disease Control and PreventionNella and Leon Benoziyo Center for Neurological Diseases, Weizmann Institute of ScienceQIMR Berghofer Medical Research InstituteWellcome TrustWilhelm Sander-StiftungNational Institutes of HealthOvarian Cancer Research Fund
Mots-clésEndometrial cancerGenome-wide association studyBiologyCandidate geneOncologyLocus (genetics)GeneticsCancerSingle-nucleotide polymorphismInternal medicineCancer researchGeneMedicineGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Endometrial cancer is the most common gynaecological cancer in high-income countries. In addition to environmental risk factors, genetic predisposition contributes towards endometrial cancer development but is still incompletely defined. METHODS: Building on genome-wide association studies (GWASs) by the Endometrial Cancer Association Consortium, we conducted a GWAS meta-analysis of 17,278 endometrial cancer cases and 289,180 controls, incorporating biobank samples from the UK, Finland, Estonia and Japan. FINDINGS: GWAS analysis identified five additional risk loci (3p25.2, 3q25.2, 6q22.31, 12q21.2, and 17q24.2). Corresponding gene-based analyses supported findings for three of the five loci, at NAV3 (12q21.2), PPARG (3p25.2), and BPTF (17q24.2), as well as two additional candidate risk regions at ATF7IP2 (16p13.2-p13.13) and RPP21 (6p22.1). Validation genotyping in further independent case-control series replicated the most significant locus at 12q21.2 and corroborated risk variants located intronic to NAV3, the gene for Neuron Navigator 3. Downregulation of NAV3 in endometrial cell lines accelerated cell division and wound healing capacity whereas NAV3 overexpression reduced cell survival and increased cell death, indicating that NAV3 acts as a tumour suppressor in endometrial cells. INTERPRETATION: Our large study extends the number of genome-wide significant risk loci identified for endometrial carcinoma by about one-third and proposes a role of NAV3 as a tumour suppressor in this common cancer. FUNDING: This study was mainly supported by funding from the Wilhelm Sander Foundation, Germany, and the National Health and Medical Research Council (NHMRC) of Australia. A complete list of funding organisations is provided in the acknowledgements.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,148
Score d'incertitude au seuil0,460

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,368
Écart entre enseignants0,324 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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