Population Phylogenomics and Genetic Structure of the Polyphagous Leafminer, <i>Liriomyza trifolii</i> (Burgess) (Diptera: Agromyzidae)
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT The agromyzid leafminer Liriomyza trifolii (Burgess) is an important polyphagous pest of vegetable crops and ornamental plants. It is native to the Americas but has spread throughout the world over the past 50 years. Previous molecular research has indicated that this species contains highly distinct mitochondrial lineages suggestive of cryptic species. To better interpret the mitochondrial divergence, we used anchored hybrid enrichment datasets in order to conduct genome‐wide phylogenetic analyses. We found that individuals of L. trifolii from pepper and tomatillo populations form a monophyletic group (“PT group”) distinct from the remaining L. trifolii (“non‐PT group”). These results corroborate previous mitochondrial and nuclear datasets and indicate an absence of gene flow between the PT and non‐PT groups. This is consistent with previous work on reproductive isolation and oviposition preferences, and provides substantial evidence that the PT group represents a distinct and previously unrecognized species. The presence of two species within a nominally single pest species has important implications for management. Although there was only weak genetic differentiation between geographically disparate groups of non‐PT L. trifolii , a monophyletic group of Chinese specimens was found in a coalescent‐based analysis that is concordant with the history of invasions in Asia. Our study provides important new insight into geographic and host‐associated structure in L. trifolii .
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».