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Enregistrement W4412386340 · doi:10.1002/cbic.202500194

A Browser‐Based Tool for Assessing Accuracy of Isothermal Titration Calorimetry‐Derived Parameters: <i>K</i><sub>d</sub>, Δ<i>H</i>°, and <i>n</i>

2025· article· en· W4412386340 sur OpenAlexafffund
Tong Ye Wang, Amit Bijlani, Emily Hoi Pui Chao, Philip E. Johnson, Sergey N. Krylov

Notice bibliographique

RevueChemBioChem · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
Thématiquethermodynamics and calorimetric analyses
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaYork University
Mots-clésIsothermal titration calorimetryProbabilistic logicComputer scienceConfidence intervalReliability (semiconductor)Isothermal processChemistryData miningReliability engineeringThermodynamicsStatisticsMathematicsEngineeringArtificial intelligencePhysicsPhysical chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Accurate determination of equilibrium dissociation constants (Kd) is essential for decision‐making in drug discovery and diagnostics development. Isothermal titration calorimetry (ITC), which requires no reactant labeling or immobilization, is commonly used to validate Kd values from high‐throughput screens. Yet, like other methods, ITC results can be skewed by systematic errors in reactant concentrations, a fact that is often overlooked, potentially leading to misinformed decisions. To address this, accuracy confidence intervals (ACI)‐ITC is developed, a browser‐based tool that calculates ACI for ITC‐derived parameters, offering probabilistic ranges for the true values of Kd, enthalpy change (ΔH°), and binding stoichiometry (n). Unlike traditional confidence intervals that consider only random errors, ACI‐ITC explicitly accounts for systematic errors, providing a more accurate framework to assess experimental reliability. Alongside a user‐friendly interface, it offers detailed guidance for determining uncertainties in concentrations and heat, which are critical inputs for assessing measurement accuracy. The tool's browser‐based accessibility (https://aci.sci.yorku.ca) eliminates the need for specialized installation, enabling cross‐platform compatibility and streamlining accuracy assessments. By highlighting the importance of systematic errors and providing a structured approach for their evaluation, ACI‐ITC supports more robust conclusions, fosters better‐informed decisions based on ITC measurements, and enhances the reliability of research findings.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,008
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,028
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Logiciel · Signal consensuel: Logiciel
Score de désaccord entre enseignants0,071
Score d'incertitude au seuil0,239

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0080,028
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0040,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0060,003
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0040,004
Science ouverte0,0030,004
Intégrité de la recherche0,0030,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0710,038

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreLogiciel

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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