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Enregistrement W4412427136 · doi:10.1002/edn3.70158

Impact of <scp>CO<sub>2</sub></scp>‐Induced Aquatic Acidification on Environmental <scp>DNA</scp> and <scp>RNA</scp> Shedding and Persistence

2025· article· en· W4412427136 sur OpenAlexafffund
Mark Louie D. Lopez, Kate Rolheiser, Jacob Etzkorn, Jacob J. Imbery, Matthew A. Lemay, Iria Gimenez, Caren C. Helbing

Notice bibliographique

RevueEnvironmental DNA · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEnvironmental DNA in Biodiversity Studies
Établissements canadiensUniversity of Victoria
Organismes subventionnairesHakai InstituteLiber Ero FoundationGenome CanadaTula FoundationAlliance de recherche numérique du CanadaGenome British Columbia
Mots-clésPersistence (discontinuity)RNADNAChemistryBiologyCell biologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Anticipated future increases in CO 2 levels are predicted to have a diverse array of lethal and non‐lethal effects on the marine ecosystem. While there has been extensive research on the physiological impacts of ocean acidification on marine species, our understanding of how increasing levels of carbon dioxide affect the shedding and decay of environmental DNA and RNA (eDNA/eRNA) in marine habitats is limited. This may impede the effective adoption of environmental nucleic acid–based molecular tools for monitoring marine biodiversity and detecting rare or invasive species. In the present study, we conducted mesocosm experiments to determine the shedding and decay rate constants of eDNA and eRNA in M. gigas ( Magallana [ Crassostrea ] gigas ) using mitochondrially encoded tRNA leucine 1 ( mt‐tl1 ) marker at various partial pressures of CO 2 in seawater. To our knowledge, this is the first study manipulating seawater pH using CO 2 . We developed a sensitive and specific quantitative PCR‐based assay to detect M. gigas eDNA and eRNA. Higher CO 2 levels increased shedding rates, indicating greater organism stress and biological effects on oysters. Additionally, increased CO 2 accelerates DNA and RNA decay, suggesting that ocean acidification may impact the reliability of eDNA‐based biodiversity monitoring. Furthermore, eRNA displayed lower steady‐state concentrations and a shorter persistence time in comparison to eDNA, as is consistent with known biochemical properties of the molecules. These findings are presented in the context of previous work that adjusted pH through acid–base adjustment and temperature and highlight the importance of considering ocean acidification caused by differing CO 2 levels when using molecular tools for marine conservation and fisheries management.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,260
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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