High Propensity for Multidrug-Resistant Pneumococcal Shedding Among Adults Living With HIV on Stable Antiretroviral Therapy in Malawi
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background People living with human immunodeficiency virus (HIV; PLHIV) on antiretroviral therapy (ART) are still at risk of pneumococcal disease and have over 2-fold higher pneumococcal carriage prevalence than HIV-uninfected (HIV−) adults). Carriage is a risk factor for pneumococcal disease, antimicrobial resistance (AMR) emergence, and transmission. Therefore, we tested whether the high prevalence of pneumococcal carriage in PLHIV on ART is associated with increased bacterial density, shedding, and AMR. Methods We recruited asymptomatic PLHIV on ART for >1 year (PLHIV-ART>1y) and HIV− adults. Nasopharyngeal swab samples were collected on days 3, 7, 14, 21, and 28, followed by monthly collections for 12 months, while shedding samples were collected on days 3, 21, and 28. Peripheral blood samples were collected on day 3 to measure CD4 cell count and HIV viral load. Pneumococcal carriage density and shedding were assessed using standard bacterial culture, multiple carriage was detected using whole-plate sweep sequencing, and AMR profiling was conducted using disk diffusion and Etest. Results PLHIV-ART>1y had a higher propensity for high-density carriage (adjusted odds ratio, 1.67 [95% confidence interval (CI), 1.07–2.60]; P = .02). Moreover, PLHIV-ART>1y are more likely to shed pneumococci than HIV− adults (adjusted odds ratio, 2.52 [95% CI, 1.06–6.00]; P = .04), with carriage density identified as an important risk factor for shedding (3.35 [1.55–7.24]; P = .002). Aerosol shed isolates from PLHIV-ART>1y were mostly multidrug resistant (18 of 29 [ 62%; 95% CI, 48%–77%]). Conclusions These findings indicate that PLHIV-ART>1y remain at high risk of pneumococcal disease and could also be an important reservoir for shedding multidrug-resistant pneumococci.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».