A Pair of DNA Aptamers That Can Selectively Bind to Bilirubin and Biliverdin
Notice bibliographique
Résumé
Bilirubin and biliverdin are two important metabolites from the degradation of heme. Development of aptamers for them will not only help with the measurement of their concentrations for diagnosing diseases such as neonatal jaundice and liver dysfunction, but may also aid in developing molecular switches for the regulation of gene expression. In this work, we report the selection of DNA aptamers against bilirubin and biliverdin. For the biliverdin selection, the tightest affinity aptamer has a dissociation costant ( K d ) value of 6 nM determined using isothermal titration calorimetry (ITC), and using a fluorescent strand-displacement assay, a limit of detection of 0.7 nM was achieved. This strand-displacement sensor also showed a response to bilirubin, although with a 10-fold lower affinity. For the bilirubin selection, many sequences obtained were also present in the biliverdin selection, and it was attributed to the oxidation of a fraction of bilirubin to biliverdin by air. This oxidation was confirmed by a visual color change of bilirubin and by UV–vis spectroscopy. The tightest binding bilirubin aptamer has a K d value of 203 nM based on ITC, and a detection limit of 47 nM was achieved using the strand-displacement assay. This pair of aptamers offer insights into molecular recognition of heme breakdown products and may be useful for developing biosensors and intracellular molecular switches.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».