High genomic stability of Andes virus following successive passage <i>in vivo</i> in Syrian hamsters
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Andes virus (ANDV) is a South American hantavirus that causes hantavirus cardiopulmonary syndrome (HCPS), a severe respiratory infection with a case fatality rate as high as 40%. A critical model for studying HCPS is the Syrian hamster model, which faithfully recapitulates key aspects of the disease. Recent studies have shown that strains of ANDV from different origins, i.e., from rodent or human hosts, can produce widely different outcomes in the hamster model. CHI-7913, a human isolate, does not cause lethal disease and replicates poorly in hamster tissues compared with the classical rodent isolate Chile-9717869. Here, we passaged CHI-7913 in vivo in Syrian hamsters 25 times and infected groups of hamsters with virus from passages 2, 12, and 24 to assess whether viral adaptation occurs that might ultimately drive the phenotype of the virus during infection in this model. Very few mutations occurred during passage in hamsters, with only a single coding mutation discovered after 25 passages. Nearly all mutations occurring in hamsters occurred early, within two passages, and none of the passaged virus caused overt disease or pathology in infected hamsters, consistent with minimal changes in the viral genome. Early in infection, CHI-7913 viral RNA levels were still well below those seen in lethal Chile-9717869 infection. Overall, our data offer insights into the lack of selective pressure on hantaviruses in certain hosts and further evidence of distinct outcomes between rodent and human-derived viral isolates that should be studied further in additional viral species. IMPORTANCE Infection of Syrian hamsters with Andes virus (ANDV) can result in disparate outcomes, depending on the source of the virus used for the infection. The ANDV strain CHI-7913 does not cause lethal disease in hamsters but is able to replicate in hamster tissues. We successively passaged CHI-7913 in vivo to study how continued infection influences adaptation in hamsters and whether passaging would lead to the development of a lethal model, as sometimes occurs with other viruses. Surprisingly, even after 25 passages, minimal mutations occurred in ANDV CHI-7913 genomes, with only one coding mutation present above consensus by passage 25, in the viral glycoprotein. Our data suggest that depending on both viral origin and the host, hantaviruses may face minimal selective pressure to mutate toward a disease phenotype. Studies with additional ANDV strains and other hantavirus species are warranted to further study this phenomenon.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».