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Enregistrement W4412653696 · doi:10.1099/jgv.0.002113

Summary of taxonomy changes ratified by the International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) from the Animal DNA Viruses and Retroviruses Subcommittee, 2025

2025· article· en· W4412653696 sur OpenAlexaff
Arvind Varsani, Adly M. M. Abd‐Alla, Niklas Arnberg, Kelly S. Bateman, Mária Benkő, Annie Bézier, Philippe Biagini, Jamie Bojko, Anamarija Butković, Marta Canuti, V. Celer, Jean‐Michel Drezen, László Egyed, Matthias Fischer, Sarah François, Benjamin Guinet, Balázs Harrach, Robert L. Harrison, Elisabeth A. Herniou, Michael Heß, Jia Hu, Johannes A. Jehle, Győző L. Kaján, Adriana E. Kajon, Eugene V. Koonin, Simona Kraberger, Peter J. Krell, Mart Krupovìč, Jens H. Kuhn, Chengfeng Lei, Matthieu Leobold, Fabrizio Maggi, Suresh K. Mittal, Hiroaki Okamoto, Tanja Opriessnig, Xiaowei Peng, Judit J. Pénzes, Iva I. Podgorski, Thomas S. Postler, Bergmann Morais Ribeiro, Carmen San Martı́n, Maria Söderlund‐Venermo, Xiulian Sun, András Surján, Zoltán László Tarján, Julien Varaldi, Márton Z. Vidovszky, Göran Wadell, Hidemi Watanabe, Natalya Yutin, Monique M. van Oers

Notice bibliographique

RevueJournal of General Virology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVirus-based gene therapy research
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institute of General Medical SciencesNational Institutes of Health
Mots-clésBiologyVirus classificationTaxonomy (biology)VirologyZoologyGeneticsGenome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) holds a ratification vote annually after review of newly proposed taxa by ICTV Study Groups and members of the virology community. In March 2025, the vote outcome of the 11 proposals within the mandate of the Animal DNA Viruses and Retroviruses Subcommittee was made public. Here, we provide a summary of the newly accepted proposals. These include reorganization of taxa in the realm Varidnaviria , classification of the ‘polinton-like’ viruses into a new family ( Phypoliviridae ) within a new order Archintovirales ; establishment of a new phylum ( Commensaviricota ) in the kingdom Shotokuvirae ; the establishment of a new family called Filamentoviridae with two new genera and three new species; the addition of four new genera in the family Anelloviridae with 70 new species; and the addition of 85 new species in the families Adenoviridae ( n =16), Baculoviridae ( n =5), Circoviridae ( n =5), Parvoviridae ( n =55) and Polyomaviridae ( n =4). Also, in the family Belpaoviridae , 11 species were renamed to comply with the binomial requirement for species names.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,132
Score d'incertitude au seuil0,550

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,298
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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