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Enregistrement W4412657782 · doi:10.1016/j.vaccine.2025.127504

Longitudinal Meta-cohort study protocol using systems biology to identify vaccine safety biomarkers

2025· article· en· W4412657782 sur OpenAlexafffund
Joann Diray‐Arce, Ana C. Chang, Sara Moradipoor, Donato Amodio, Bruce Carleton, Wan‐Chun Chang, Nigel W. Crawford, Meagan Karoly, Annmarie Hoch, Kerry McEnaney, Tahir S Kafil, Mahitha Donthireddy, Sarah K. Steltz, Simon D. van Haren, Asimenia Angelidou, Kinga K. Smolen, Hanno Steen, Jessica Lasky‐Su, Huyen Tran, Peter Liu, C. Buddy Creech, Clare Cutland, Helen Petousis‐Harris, Ishac Nazy, Rae S. M. Yeung, Sonali Kochhar, Steve Black, Nicholas Wood, Dale Nordenberg, Paolo Palma, Inna G. Ovsyannikova, Richard B. Kennedy, Gregory A. Poland, Al Ozonoff, Robert T. Chen, Ofer Levy, Karina A. Top

Notice bibliographique

RevueVaccine · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
Thématiquevaccines and immunoinformatics approaches
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenWomen and Children’s Health Research InstituteUniversity of OttawaBC Children's HospitalUniversity of TorontoMcMaster UniversityUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchU.S. Food and Drug AdministrationIstituto di Ricovero e Cura a Carattere ScientificoCenters for Disease Control and PreventionMinistero della SaluteDepartment of Health and Ageing, Australian GovernmentCoalition for Epidemic Preparedness Innovations
Mots-clésMedicineVaccinationPharmacogenomicsBioinformaticsIntensive care medicineImmunologyBiologyPharmacology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The International Network of Special Immunization Services (INSIS) was established to investigate the causes and risk factors of rare adverse events following immunizations (AEFIs) and develop immunization strategies for mitigating or preventing risk for individuals with prior AEFIs or at risk of AEFIs. INSIS integrates clinical data with multi-omic technologies (e.g., transcriptomics, proteomics, metabolomics) through a global consortium of clinical networks, leading immunology, pharmacogenomics teams to uncover the molecular mechanisms behind AEFIs. The network ensures accurate and standardized data collection and analysis through rigorous data management and quality assurance processes. INSIS also implements harmonized case definitions and protocols for collecting data and samples related to rare AEFIs, such as myocarditis, pericarditis, and Vaccine-Induced Immune Thrombocytopenia and Thrombosis (VITT) after COVID-19 vaccinations. This protocol outlines the comprehensive approach to enhance risk-benefit assessments of vaccines across populations, identify actionable biomarkers to inform discovery and development of safe vaccines, and support personalized vaccination strategies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,143
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,348
Écart entre enseignants0,312 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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