The <i>Ralstonia solanacearum</i> E3 ligase effector RipV1 targets subfamily IXb receptor-like cytoplasmic kinases that negatively regulate immunity in <i>Nicotiana benthamiana</i>
Notice bibliographique
Résumé
SUMMARY Plants detect microbe-associated molecular patterns from pathogens via plasma membrane- localized receptors which activate multiple signaling cascades that lead to pattern-triggered immunity (PTI). Receptor-like cytoplasmic kinases (RLCKs) are essential hubs of plant immune signaling, associating with receptors and intracellular proteins through phosphorylation events. As a consequence, RLCKs have emerged as common targets of pathogen effectors. To improve our knowledge on Solanaceae responses to the bacterial wilt pathogen Ralstonia solanacearum , we conducted a yeast two-hybrid screen between tomato RLCKs and effectors conserved in R. solanacearum Korean isolates. Several members of RLCK subfamily IXb, which contain a ubiquitin-ligase plant U-box domain in addition to the kinase domain, interacted with RipV1, an effector containing a novel E3 ligase domain (NEL). In vitro assays revealed that RLCK-IXb-1 displayed ubiquitin-ligase activity but no detectable kinase activity. RipV1 could trans- ubiquitinate RLCK-IXb-1 in vitro and promote its stability in planta . Using virus-induced gene silencing of RLCK-IXb homologs in Nicotiana benthamiana , we could further show that several RLCK-IXb proteins act as negative regulators of early PTI signaling. RipV1 was previously reported to contribute to R. solanacearum virulence in potato and to elicit cell death in an E3 ligase activity-dependent manner in N. benthamiana . Here we show that RipV1-induced cell death occurred in plants impaired for effector recognition but could be suppressed by over-expression of RLCK-IXb-1, suggesting that this response is related to the virulence function of RipV1. Altogether, our work identifies possible substrates of an NEL effector and underlines the complex roles of RLCKs in plant immune signaling.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».