Additional Complexity in Historic and Contemporary Gene Flow Among Hoary, Vancouver Island, and Olympic Marmots Revealed by Microsatellites and Ultraconserved Elements
Notice bibliographique
Résumé
Alpine species are inordinately threatened by habitat loss and precipitation changes resulting from climate change. In North America's Pacific Northwest (PNW), three closely related alpine mammal species-hoary, Olympic, and Vancouver Island marmots-may face greater negative impacts of climate change relative to species found at lower elevations. Phylogenetic studies have found these three species form a monophyletic complex; however, discordant evolutionary histories between mitochondrial and nuclear genes suggest that gene flow may have occurred between these marmot species. Furthermore, mitochondrial data find two reciprocally monophyletic mitochondrial clades (haploclades) of hoary marmots. Nuclear data do not recover this pattern, and interspecific relationships among the markers are not consistent. We used nine microsatellite loci and ultraconserved elements (UCEs) to explore patterns of nuclear gene flow among marmot species in the PNW. Analyses of microsatellite data indicate no current gene flow between hoary and Vancouver Island marmots or between hoary and Olympic marmots but do reveal nuclear gene flow among hoary marmot haploclades. Additionally, UCE data reveal historic gene flow between hoary and Vancouver Island marmots. Overall, our results suggest that historic mitochondrial introgression between hoary and Vancouver Island marmots, as well as male-biased dispersal, are driving mito-nuclear discordance in this species complex.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».