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Enregistrement W4412695671 · doi:10.1099/jgv.0.002111

Summary of taxonomy changes ratified by the International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) from the Bacterial Viruses Subcommittee, 2025

2025· article· en· W4412695671 sur OpenAlexaff
Dann Turner, Evelien M. Adriaenssens, Rudolf Amann, Pavol Bárdy, Nina Bartlau, Jakub Barylski, Stanisław Błażejak, Majid Bouzari, Ariane Briegel, Yves Briers, Daniel Carrillo, Xia Chen, Dennis Claessen, Ryan Cook, Marco A. Crisci, Arnaud Dechesne, Paulina Deptula, Bas E. Dutilh, Bert Ely, Lars Fieseler, Paul C. M. Fogg, Akihito Fukudome, Mohammed Saeed Ganjoor, Iwona Gientka, Karin Holmfeldt, Panos G. Kalatzis, Kathryn M. Kauffman, Annabel Kempff, Petar Knežević, Eugene V. Koonin, Andrew M. Kropinski, Mart Krupovìč, D. İpek Kurtböke, Kai S Lambon, Rob Lavigne, Susan M. Lehman, Hui Liu, Cédric Lood, Rudi Lurz, Sari Mäntynen, Cole B. Matrishin, Mathias Middelboe, Andrew Millard, Cristina Moraru, Dennis Sandris Nielsen, Franklin L. Nóbrega, Takuro Nunoura, Hanna M. Oksanen, Véronique Ongenae, Boris Parra, Célia Pas, Joseph Pogliano, Minna M. Poranen, Siravudh Potipimpanon, Amy Prichard, Hannah V. Pye, Daniela Rothschild-Rodriguez, Daniel E. Rozen, Joanne M. Santini, Sha Yu, Dziyana Shymialevich, Barbara Sokołowska, Abbas Soleimani-Delfan, Paulina Średnicka, Paulo Tavares, Andrea Telatin, Igor Tolstoy, Shyun-ichi Urayama, Vera van Neer, Finn K. Vogensen, Qiannan Wen, Antje Wichels, Michał Wójcicki

Notice bibliographique

RevueJournal of General Virology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueBacteriophages and microbial interactions
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilBiocenter FinlandVlaamse regeringNovo Nordisk FondenSigrid Juséliuksen SäätiöBundesministerium für Bildung und ForschungNovo NordiskNational Institute of Dental and Craniofacial ResearchJane ja Aatos Erkon SäätiöFonds Wetenschappelijk OnderzoekEmil Aaltosen SäätiöVillum FondenHelsingin YliopistoNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesMedical Research CouncilAlexander von Humboldt-StiftungDeutsche ForschungsgemeinschaftDirectorate for Biological SciencesNational Institutes of HealthU.S. Department of Health and Human Services
Mots-clésTaxonomy (biology)BiologyPhylumTaxonVirus classificationBacterial taxonomyEvolutionary biologyComputational biologyVirologyZoologyEcologyGeneticsBacteriaGenomeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This article summarises the activities of the International Committee on Taxonomy of Viruses Bacterial Viruses Subcommittee, detailing developments in the classification of bacterial viruses. We provide here an overview of all new, abolished, moved and renamed taxa proposed in 2024, approved by the Executive Committee, and ratified by membership vote in 2025. Through the collective efforts of 74 international contributors of taxonomy proposals in this round, 43 ratified proposals have led to the creation of one new phylum, one class, four orders, 33 families, 14 subfamilies, 194 genera and 995 species. These proposals mark significant progress in refining the taxonomy of bacterial viruses. Key updates include the creation of new orders and families that include existing taxa to better reflect genomic and evolutionary relationships. As sequencing and bioinformatics approaches continue to advance, further expansion and refinements in viral taxonomy can be anticipated in the coming years.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,549
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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