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Enregistrement W4412729069 · doi:10.1186/s12870-025-06929-5

The path effects of a bacterial signal compound on the microbiome of canola

2025· article· en· W4412729069 sur OpenAlexaff
Bulbul Ahmed, Mahtab Nazari, Jean Legeay, Timothy Schwinghamer, Mohamed Hijri, Donald L. Smith

Notice bibliographique

RevueBMC Plant Biology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensUniversité de MontréalAgriculture and Agri-Food CanadaMcGill University
Organismes subventionnairesCustody X Change
Mots-clésBiologyCanolaPath (computing)MicrobiomeComputational biologySIGNAL (programming language)BiotechnologyGeneticsBotanyComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Bacillin 201 has been shown to act as a biostimulant, it enhances seed germination and increases the biomass of soybean and canola plants. However, the mechanisms underlying these benefits, and their impacts on the plant-associated microbiome, remain unquantified. In this study, we investigated the causal effects of bacillin 20 on the bacterial communities associated with canola. RESULTS: We conducted a field study with three different concentrations of bacillin 20 as seed treatment and foliar spray on canola cultivar InVigor L233P followed by a randomized complete block design in clay loam and sandy loam soils and investigated how bacillin 20 influences the structure and richness of bacterial communities across biotypes, including those in root tissues and rhizosphere soil. Our findings revealed that rhizosphere soil bacterial communities clustered closely in the studied clay loam soil. Bacterial alpha diversity did not respond significantly to bacillin 20 treatments, however, Rhizobiales bacteria become most abundant in the rhizosphere soil. Also, four bacteria- Rosemicrobium sp., Sphingomonas sp. and two unclassified Planctomycetes were identified as indicator species in the microbial communities from both clay-loam and sandy-loam soils. We analysed causal relationships between the effects of bacillin 20 and experimentally controlled factors affecting bacterial communities, such as those associated with root tissue, soil and treatment (bacillin 20) types. Some bacterial taxa—ASV55 (Candidatus Xiphinematobacter) were negatively affected by bacillin 20 foliar treatment, and ASV73 (unidentified Tepidisphaerales) by seed treatment. CONCLUSION: Overall, our study revealed key explanatory variables influencing the effect of bacillin 20 on the bacterial communities associated with canola roots and rhizosphere soil. Although soil type (clay versus sandy loam) did not directly affect the bacterial communities, we found that bacillin 20 affected the canola root system associated microbiota. This shifts in the associated bacteria could be influenced by developmental stages, not by the treatment of bacillin 20 alone.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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