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Enregistrement W4412756801 · doi:10.26434/chemrxiv-2025-4pk4w

Semantically-Linked Ontological Knowledge Extraction Graph For Domain-Specific Knowledge Discovery In Scientific Literature

2025· preprint· en· W4412756801 sur OpenAlexafffund
Sana Kashgouli, Ali Malek, S. Shayan Mousavi Masouleh, Shahlla Naseri, Kogie Esteban, Robert E. Black, Michael S. Freund, Mita Dasog, Khalid Fatih

Notice bibliographique

RevueChemRxiv · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueSemantic Web and Ontologies
Établissements canadiensNational Research Council CanadaDalhousie University
Organismes subventionnairesNational Research Council CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaKillam TrustsDalhousie University
Mots-clésKnowledge graphKnowledge extractionComputer scienceDomain knowledgeInformation retrievalGraphScientific discoveryData scienceDomain (mathematical analysis)Natural language processingKnowledge managementArtificial intelligenceTheoretical computer sciencePsychologyMathematicsCognitive science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The rapid growth of scientific papers presents several challenges for researchers, including information overload, data fragmentation, lack of standard terminology, and limited interoperability. These issues make it increasingly difficult to keep up with the literature and extract useful, field-specific information efficiently. To address these challenges, we introduce the semantically-linked ontological knowledge extraction framework, a tool that combines smart linking of concepts, flexible ontology building, and graph-based reasoning to organize and extract knowledge. This semantically-linked ontological knowledge extraction graph (SOKE Graph) leverages large-language models to extract domain-specific concepts from scientific articles, ensuring both semantic accuracy and adaptability to new data. These concepts are organized using an ontology—a structured framework of terms and relationships—that supports systematic data collection by grouping information into clearly defined layers. The resulting knowledge graph enables structured representation of extracted domain-specific information, allowing researchers to explore relationships between concepts and efficiently retrieve relevant data aligned with the objectives of this work. This approach allows SOKE Graph to find the connections between concepts and publications, and retrieve the most relevant studies in response to user questions. Initial evaluations of SOKE Graph show that it helps improve the accuracy of filtering high-relevance papers from large datasets compared to using only large-language models, and generates structured, interpretable outputs that facilitate data-driven insights. Moreover, this framework provides a robust and scalable artificial intelligence-based tool that accelerates literature analysis, guides decision-making, and helps researchers efficiently locate relevant information within complex scientific domains.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,015
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,020

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,015
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,003
Bibliométrie0,0170,014
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0030,005
Science ouverte0,0010,004
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,318
Écart entre enseignants0,276 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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