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Enregistrement W4412767316 · doi:10.1101/2025.07.29.25332360

segcsvd <sub>PVS</sub> : A convolutional neural network-based tool for quantification of enlarged perivascular spaces (PVS) on T1-weighted images

2025· preprint· en· W4412767316 sur OpenAlexaff
Erin Gibson, Joel Ramirez, Lauren Abby Woods, Stephanie Berberian, Julie Ottoy, Christopher J.M. Scott, Vanessa Yhap, Fuqiang Gao, Roberto Duarte Coello, Maria C. Valdés-Hernández, Aaron W. Lange, Carmela M. Tartaglia, Sanjeev Kumar, Malcolm A. Binns, Robert Bartha, Sean Symons, Richard H. Swartz, Mario Masellis, Navneet Singh, Bradley J. MacIntosh, Joanna M. Wardlaw, Sandra E. Black

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueCerebrospinal fluid and hydrocephalus
Établissements canadiensWestern UniversityPublic Health OntarioCentre for Addiction and Mental HealthUniversity of TorontoUniversity Health NetworkToronto Western HospitalSunnybrook Health Science CentreToronto ZooBaycrest HospitalOntario Brain Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésConvolutional neural networkArtificial intelligenceComputer sciencePattern recognition (psychology)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Introduction Enlarged perivascular spaces (PVS) are imaging markers of cerebral small vessel disease (CSVD) that are associated with age, disease phenotypes, and overall health. Quantification of PVS is challenging but necessary to expand an understanding of their role in cerebrovascular pathology. Accurate and automated segmentation of PVS on T1-weighted images would be valuable given the widespread use of T1-weighted imaging protocols in multisite clinical and research datasets. Methods We introduce segcsvd PVS , a convolutional neural network (CNN)-based tool for automated PVS segmentation on T1-weighted images. segcsvd PVS was developed using a novel hierarchical approach that builds on existing tools and incorporates robust training strategies to enhance the accuracy and consistency of PVS segmentation. Performance was evaluated using a comprehensive evaluation strategy that included comparison to existing benchmark methods, ablation-based validation, accuracy validation against manual ground truth annotations, correlation with age-related PVS burden as a biological benchmark, and extensive robustness testing. Results segcsvd PVS achieved strong object-level performance for basal ganglia PVS (DSC = 0.78), exhibiting both high sensitivity (SNS = 0.80) and precision (PRC = 0.78). Although voxel-level precision was lower (PRC = 0.57), manual correction improved this by only ~3%, indicating that the additional voxels reflected primary boundary- or extent-related differences rather than correctable false positive error. For non-basal ganglia PVS, segcsvd PVS outperformed benchmark methods, exhibiting higher voxel-level performance across several metrics (DSC = 0.60, SNS = 0.67, PRC = 0.57, NSD = 0.77), despite overall lower performance relative to basal ganglia PVS. Additionally, the association between age and segmentation-derived measures of PVS burden were consistently stronger and more reliable for segcsvd PVS compared to benchmark methods across three cohorts (test6, ADNI, CAHHM), providing further evidence of the accuracy and consistency of its segmentation output. Conclusions segcsvd PVS demonstrates robust performance across diverse imaging conditions and improved sensitivity to biologically meaningful associations, supporting its utility as a T1-based PVS segmentation tool.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,021

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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