Gut microbiota development, antibiotic resistome, and related perinatal factors in early infancy
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Early life is a critical window for gut microbiota development and antibiotic resistome. We aimed to investigate the microbiota longitudinal change during the first 6 months of life and the differences associated with assisted reproductive technology (ART) treatment, mode of delivery, and infant sex. Gut microbiota was measured by metagenomic sequencing of fecal samples repeatedly collected within 3 days after birth, at 42 days, 3 months, and 6 months in 155 Chinese infants. Among infants born by vaginal delivery, the ACE, Chao, and Sobs indexes increased with age. Accordingly, the relative abundance of Actinobacteria phylum increased from 43% ± 37% (mean ± SD) to 57% ± 36% and Proteobacteria phylum decreased from 48% ± 36% to 17% ± 25%; and Bifidobacterium and Klebsiella genus increased and Escherichia genus decreased, from the first 3 days to 6 months. The dominant antibiotic resistance genes were macB and msbA . Boys and girls had similar features. Infants born by cesarean section exhibited a similar gut microbiota developmental trajectory, but with a slower increase in alpha diversity over time, and lower Bacteroidetes phylum and Bacteroides genus at each age point. Compared with non-ART infants, ART infants had slightly higher alpha diversity indexes of ACE, Chao, Sobs, Shannon, and Pielou’s evenness at age 42 days among infants born by vaginal delivery. Our findings confirm increasing diversity and composition evolution of gut microbiota in the first 6 months of life. Both modes of delivery and ART conception are associated with early gut microbiota alteration. IMPORTANCE Gut microbiota plays an important role in various aspects of human health. Early life is a critical period for the development of gut microbiota. In this prospective study, we observed that the diversity and antibiotic resistance genes of gut microbiota increased gradually with age in the first 6 months of life. Boys and girls had similar features of gut microbiota. Cesarean section was associated with a lower abundance of Bacteroidetes phylum and Bacteroides genus. Compared with non-ART infants (spontaneous conception), ART infants had slightly higher alpha diversity indexes of ACE, Chao, Sobs, Shannon, and Pielou’s evenness at age 42 days among infants born by vaginal delivery. This study presents gut microbiota development with age, antibiotic resistome, and related perinatal factors in early infancy.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».