MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4412815671 · doi:10.1038/s41467-025-62453-y

Regulation of airway fumarate by host and pathogen promotes Staphylococcus aureus pneumonia

2025· article· en· W4412815671 sur OpenAlexafffund
Ying-Tsun Chen, Zihua Liu, Dario Fucich, Stefano Giulieri, Zhe Liu, Ridhima Wadhwa, Gustavo Rios-Delgado, Henning Henschel, N. Tyagi, Françios A.B. Olivier, Ian R. Monk, Shivang S. Shah, Shwetha Hara Sridhar, Marija Drikic, Colleen Bianco, Gaurav Kumar Lohia, Ayesha Z. Beg, Paul J. Planet, Ian A. Lewis, Robert Sebra, Ana Traven, Abderrahman Hachani, Timothy P. Stinear, Benjamin P. Howden, Jeffrey M. Boyd, Sebastián A. Riquelme, Chu Wang, Alice Prince, Tania Wong Fok Lung

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntimicrobial Resistance in Staphylococcus
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesOffice of Extramural Research, National Institutes of HealthNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institute of General Medical SciencesNational Heart, Lung, and Blood InstituteSchool of Medicine, Shanghai Jiao Tong UniversityNational Health and Medical Research CouncilInternational Microbiome Centre, University of CalgaryNational Center for Research ResourcesCanterbury Medical Research FoundationWeill Cornell Medical CollegeAlberta InnovatesNational Science FoundationShanghai Jiao Tong UniversityU.S. Department of AgricultureWestfälische Wilhelms-Universität MünsterNational Institutes of HealthU.S. Department of Health and Human ServicesYale University
Mots-clésStaphylococcus aureusCitric acid cycleMetabolic pathwayBiologyMicrobiologyDimethyl fumarateFumaric acidStaphylococcal infectionsEnzymeImmunologyBiochemistryBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Staphylococcus aureus is a leading cause of healthcare-associated pneumonia, contributing significantly to morbidity and mortality worldwide. As a ubiquitous colonizer of the upper respiratory tract, S. aureus must undergo substantial metabolic adaptation to achieve persistent infection in the distinctive microenvironment of the lung. We observed that fumC, which encodes the enzyme that converts fumarate to malate, is highly conserved with low mutation rates in S. aureus isolates from chronic lung infections. Fumarate, a pro-inflammatory metabolite produced by macrophages during infection, is regulated by the host fumarate hydratase (FH) to limit inflammation. Here, we demonstrate that fumarate, which accumulates in the chronically infected lung, is detrimental to S. aureus, blocking primary metabolic pathways such as glycolysis and oxidative phosphorylation (OXPHOS). This creates a metabolic bottleneck that drives staphylococcal FH (FumC) activity for airway adaptation. FumC not only degrades fumarate but also directs its utilization into critical pathways including the tricarboxylic acid (TCA) cycle, gluconeogenesis and hexosamine synthesis to maintain metabolic fitness and form a protective biofilm. Itaconate, another abundant immunometabolite in the infected airway enhances FumC activity, in synergy with fumarate. In a mouse model of pneumonia, a ΔfumC mutant displays significant attenuation compared to its parent and complemented strains, particularly in fumarate- and itaconate-replete conditions. Our findings underscore the pivotal role of immunometabolites in promoting S. aureus pulmonary adaptation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,292
Écart entre enseignants0,282 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueNature CommunicationsMême sujetAntimicrobial Resistance in StaphylococcusTravaux en français237 207