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Enregistrement W4412853873 · doi:10.1101/2025.07.30.663632

Community Challenge towards Consensus on Characterization of Biological Tissue: C <sup>4</sup> Bio’s First Findings

2025· preprint· en· W4412853873 sur OpenAlexaff
Nele Famaey, Heleen Fehervary, Yoann Lafon, Ali Akyildiz, Silke Dreesen, Karine Bruyère-Garnier, Jean‐Marc Allain, Marta Alloisio, Alejandro Aparici-Gil, Chiara Catalano, Fanette Chassagne, Snehal Chokhandre, Kimberly Crevits, Hanneke Crielaard, Eoghan M. Cunnane, Connor V. Cunnane, Karen De Leener, Amisha Desai, Rob Driessen, Mona Eskandari, Sam Weiss Evans, Christian Gasser, Marc Gebhardt, Birgit Glasmacher, Gerhard A. Holzapfel, Mikel Isasi, Louise M. Jennings, Sascha Kurz, Sara Leal‐Marin, Pauline Lecomte‐Grosbras, Annie Morch, John J. Mulvihill, Fulufhelo Ṋemavhola, Thanyani Pandelani, Salvatore Pasta, Estefanía Peña, Baptiste Pierrat, Heidi‐Lynn Ploeg, Stanislav Polzer, Manuel K. Rausch, David Schwarz, Hazel R. C. Screen, Selda Sherifova, Gerhard Sommer, Shengzhang Wang, D. Walsh, Thierry Marchal, Liesbet Geris

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueElasticity and Material Modeling
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCharacterization (materials science)BIOSComputational biologyComputer sciencePolitical scienceBiologyNanotechnologyMaterials scienceOperating system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract This study investigates methodological variability across various expert laboratories worldwide, with regards to characterizing the mechanical properties of biological tissues. Two testing rounds were conducted on the specific use case of uniaxial tensile testing of porcine aorta. In the first round, 24 labs were invited to apply their established methods to assess inter-laboratory variability. This revealed significant methodological diversity and associated variability in the stress-stretch results, underscoring the necessity for a standardized approach. In the second round, a consensus protocol was collaboratively developed and adopted by 19 labs in an attempt to minimize variability. This involved standardized sample preparation and uniformity in testing protocol, including the use of a common cutting and thickness measurement tool. Despite protocol harmonization, significant variability persisted across labs, which could not be solely attributed to inherent biological differences in tissue samples. These results illustrate the challenges in unifying testing methods across different research settings, underlining the necessity for further refinement of testing practices. Enhancing consistency in biomechanical experiments is pivotal when comparing results across studies, as well as when using the resulting material properties for in silico simulations in medical research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,030
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,225
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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