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Enregistrement W4413007008 · doi:10.1016/j.indcrop.2025.121636

Integrated transcriptomic and physio-molecular analysis reveals the mechanism of Bacillus subtilis TP01-mediated cadmium detoxification in Ligusticum chuanxiong Hort.

2025· article· en· W4413007008 sur OpenAlexfundno aff
Zhong Tian, Shuang Guo, Lin Chen, Liang Fang, Siyi Yu, Lan Yang, Yong Huang

Notice bibliographique

RevueIndustrial Crops and Products · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Stress Responses and Tolerance
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Science Foundation of Sichuan ProvinceChengdu University of Traditional Chinese MedicineNational Natural Science Foundation of ChinaUniversity of Alberta
Mots-clésBacillus subtilisDetoxification (alternative medicine)CadmiumChemistryMechanism (biology)TranscriptomeTraditional medicineBiochemistryBiologyBacteriaGene expressionGeneMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cadmium (Cd) contamination adversely impacts both the productivity and quality of numerous crops, including cereals, fruits, vegetables, and medicinal plants. Medicinal plants, in particular, produce valuable metabolites with substantial economic, medicinal, and nutritional importance. However, Cd stress not only suppresses their growth and bioactive metabolite production but also leads to significant Cd accumulation in harvested tissues, posing both economic threats and potential health hazards. Plant growth-promoting bacteria (PGPB), especially Bacillus spp., have been extensively employed to alleviate Cd toxicity in various crops. However, compared to conventional cash crops, the roles of Bacillus spp.-mediated Cd detoxification in medicinal plants remain less clearly defined. In this study, Ligusticum chuanxiong Hort., a medicinal species frequently exposed to severe Cd contamination during cultivation, was selected as a model plant. We identified a Cd-resistant PGPB strain, Bacillus subtilis TP01, and elucidated its protective effects and mechanisms against Cd stress in L. chuanxiong . Pot experiments and field trials demonstrated that B. subtilis TP01 effectively alleviated Cd-induced growth inhibition, restored the production of bioactive ingredients, and decreased Cd accumulation within plant tissues. Transcriptomic and molecular analyses revealed that B. subtilis TP01 triggered systemic jasmonic acid (JA) biosynthesis. Moreover, exogenous application of methyl jasmonate, a JA derivative, largely mimicked the protective effects observed with B. subtilis TP01 inoculation, highlighting JA signaling as the central regulatory mechanism. Further investigations indicated that B. subtilis TP01-mediated JA signaling enhanced antioxidant responses and modulated Cd transporter gene expression, thereby mitigating Cd-induced oxidative stress and reducing Cd uptake. These findings elucidate a novel phytohormone-dependent microbial-plant interaction mechanism, illustrating how PGPB coordinate plant development and stress responses. This study proposes a safe, efficient, and economical approach for managing Cd contamination in medicinal plants and provides theoretical support for their sustainable cultivation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,218
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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