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Enregistrement W4413015175 · doi:10.1016/j.marmicro.2025.102500

Radiolarian and Phaeodarian high-rank assemblage change through time in the Scotia Sea: A paleo-genomics approach (IODP Exp. 382)

2025· article· en· W4413015175 sur OpenAlex
Vikki Lowe, T. Biard, Guiseppe Cortese, Iván Hernández‐Almeida, K.-A. Lawler, L. Armbrecht

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueMarine Micropaleontology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueGeology and Paleoclimatology Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesSerono Symposia International FoundationAgence Nationale de la RechercheMinistry of Business, Innovation and EmploymentUniversity of Tasmania
Mots-clésAssemblage (archaeology)GeologyNova scotiaOceanographyPaleontologyGenomicsRank (graph theory)BiologyGeneGeneticsGenome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Radiolaria and Phaeodaria are single-celled eukaryotic zooplankton that inhabit diverse marine environments. While the sedimentary fossil record reveals their ancient origins and morphological diversity, recent advancements in metagenomics and sedimentary ancient DNA ( seda DNA) techniques have highlighted the significant contributions of rarely preserved taxa (e.g., those that are only lightly silicified or soft-bodied) to marine biodiversity and the carbon cycle. Using a paleo-genomic approach, we produced a sed aDNA-based time series of the Radiolarian and Phaeodarian community from the Scotia Sea covering the last 500 kyr. We compared the use of two reference databases, one Radiolarian- and Phaeodarian-specific (RPD) and one more comprehensive eukaryote database (PR 2 ), to assess the validity of a small, taxa-specific database. We determined that the two databases produced comparable results, showing that the overall assemblage changes at the glacial-interglacial scale were similar. At the Class level, Radiolarian and Phaeodarian assemblages appear to have experienced compositional changes during termination events and warm Interglacial periods. This study produced the first Radiolarian- and Phaeodarian-specific reference database. We showed that the Class-level changes that occurred over the last 500 kyr were associated with glacial-interglacial (G-I) cycles, and no permanent shifts away from the natural variation associated with the G-I cycles were found.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,131
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle