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Enregistrement W4413031473 · doi:10.1101/2025.08.01.25332809

Advancing Non-Invasive Respiratory Diagnostics: Multiplex Nasal Biomarker Profiling for Stratification of Airway Inflammatory Diseases

2025· preprint· en· W4413031473 sur OpenAlexaff
Tanya Lupancu, Sharmala Thuraisingam, Eldin Rostom, David M. Yen, Brian Wang, Adam M. Damry

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSinusitis and nasal conditions
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMultiplexProfiling (computer programming)BiomarkerRespiratory systemMedicineBiomarker discoveryAirwayRisk stratificationImmunologyInternal medicineBioinformaticsBiologyComputer scienceProteomicsSurgeryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT This study explores the potential of nasal secretions to serve as a source of biomarkers for diagnosing respiratory conditions. A total of 40 inflammatory biomarkers were detected and quantified in participants with upper respiratory diseases, including chronic rhinosinusitis (CRS), allergic rhinitis, and viral and bacterial infections. The different expression levels of various biomarkers could distinguish CRS participants with and without nasal polyps (i.e. CRP, GzmB, IL-4, MMP-1, MMP-8, SAA and TREM-1), and healthy and rhinitis participants (i.e. CRP, EGF, Eotaxin-1, Fractalkine, IL-1RA, IL-5, IP-10 and TRAIL). CRP, G-CSF, GzmA, IL-1, IL-2, IL-5, IL-8, IL-9, MMP-1, TNFa and TREM-1 protein expression differed between the healthy, viral and bacterial-infected individuals, and EGF, G-CSF, MCP-1, MIP1a and MIP-1b protein expression differed between type 2 and non-type 2 inflammatory cohorts. Significant correlations were also noted between SNOT-22 scores and specific cytokines, such as IP-10 and TRAIL. Despite the heterogeneity of patient diagnoses, these findings highlight the potential of nasal fluid as a readily accessible reflection of respiratory health. Future studies with larger cohorts and standardized methodologies are needed to validate these biomarkers and potentially enable precision diagnosis and improved treatment of respiratory conditions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,319
Écart entre enseignants0,291 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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