Guyparkeria halopsychrophila sp. nov., a chemolithoautotrophic polyextremophile isolated from a sub-zero Arctic hypersaline spring
Notice bibliographique
Résumé
Two eurypsychrophilic and halophilic sulphur-oxidizing bacterial strains (LHSS19-1T and GHLCS8-2) were isolated from High Arctic hypersaline sulphur spring sediment samples collected from the Lost Hammer and Gypsum Hill spring systems on Axel Heiberg Island in the Qikiqtaaluk Region, Nunavut, Canada. The strains were obligate chemolithoautotrophs, utilizing reduced sulphur compounds (thiosulphate, sulphide, tetrathionate and elemental sulphur) as electron donors and energy sources. Chemolithoautotrophic growth on thiosulphate was observed at −2 to 37 °C, pH 6.5–9.5 and NaCl concentrations of 1–20 % w/v. The DNA G+C content of the draft genome sequences was 64.59–64.74 mol%. Phylogenetic analyses based on 16S rRNA gene sequences, 92 single-copy core genes and whole genomes indicated that both strains together form a distinct monophyletic clade within the genus Guyparkeria. Moreover, in silico DNA–DNA hybridization, orthologous average nt identity and average aa identity values calculated between each strain and the closest related type strains were ≤69.10%, 87.83% and 90.37%, respectively. The genomes of both strains encoded high O2 affinity cbb3 -type cytochrome c oxidase genes but distinctively lacked a complete set of aa3 -type cytochrome c oxidase genes. The dominant respiratory quinone of strain LHSS19-1T was ubiquinone-8. The major fatty acids (>10%) were C18 : 1 ω7c, C12 : 0 3OH and C16 : 0. Based on phenotypic and genotypic results, strains LHSS19-1T and GHLCS8-2 represent a novel species within the genus Guyparkeria, for which the name Guyparkeria halopsychrophila sp. nov. is proposed. The type strain is LHSS19-1T (=NCTC 15100T=DSM 117890T).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».