MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4413054838 · doi:10.1111/ocr.70015

Utilising Next‐Generation Sequencing to Explore the Molecular Etiology of Short Root Anomaly

2025· article· en· W4413054838 sur OpenAlexaff
Emily A. Joy, David K. Crossman, Mary MacDougall, Quamarul Hassan, Ejvis Lamani

Notice bibliographique

RevueOrthodontics and Craniofacial Research · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
Thématiquedental development and anomalies
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute of Dental and Craniofacial ResearchAmerican Association of Orthodontists Foundation
Mots-clésSanger sequencingBiologyGeneticsGeneMutationExome sequencingDNA sequencingGene mutationMolecular biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: Short Root Anomaly (SRA) is a genetic dental disorder affecting tooth root development. The affected teeth have abnormally short roots and significantly reduced root to crown ratios. The aim of this study was to determine the mode of inheritance and the molecular aetiology of SRA in identified Hispanic families. METHODS: Dental history was taken from 5 Hispanic families. SRA diagnosis was based on 1:1.1 C:R ratios. Whole saliva was collected from eight SRA-affected and five unaffected family members with informed consent. DNA was extracted and processed for whole exome sequencing (WES). Gene mutations associated with SRA were confirmed by Sanger sequencing. Gene expression in dental cells was examined by qRT PCR, and protein localisation was determined by immunocytochemistry. Chromatin immunoprecipitation (ChIP) assay was used to confirm gene regulation. RESULTS: SRA exhibited an autosomal dominant pattern of inheritance in three of the five families examined. The other two families may represent a recessive trait or de novo mutations. WES analysis identified a rare mutation (rs138075877) in the H1C gene of the affected individuals from two of the AD SRA families exhibiting a localised SRA phenotype. We found this gene was differentially expressed in dental mesenchymal and epithelial cells. Finally, ChIP showed that H1C is directly regulated by a root master gene NFIC. CONCLUSION: Our data demonstrates that a mutation in the H1C gene may have a causal role in AD SRA.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,089
Score d'incertitude au seuil0,330

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,189
Tête enseignante GPT0,394
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueOrthodontics and Craniofacial ResearchMême sujetdental development and anomaliesTravaux en français237 207