A New Strain of <scp>16SrI</scp> Group Phytoplasma Associated With Witches' Broom and Decline of Pacific Willow ( <scp> <i>Salix lucida</i> </scp> )
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Phytoplasmas are transmitted by phloem‐sucking insect vectors and by vegetative propagation of infected plants. Pacific willow is an ecologically valuable and excellent wetland restoration plant in western North America. Pacific willow trees showing witches' broom (WB) and decline were observed growing on southern Vancouver Island, British Columbia, Canada. Phytoplasma infection was confirmed using a real‐time PCR assay targeting 16S rRNA genes. In silico restriction analysis of the F2nR2 region sequence, with iPhyClassifier, revealed that the restriction pattern of the detected phytoplasma was different from all previously established 16Sr subgroups, and the detected phytoplasma may represent a new strain in the 16SrI group. CpnClassiPhyR analysis of cpn60 universal target (UT) indicated that the detected phytoplasma is a probable new subgroup in Cpn60 UT I. Complete 16S rRNA, rpsP and rplS gene sequences were assembled from short‐read phytoplasma genome sequence data obtained from symptomatic willow trees. Phylogenetic analysis of 16S rRNA, rpsP and rplS genes also confirmed that the phytoplasma detected in WB symptomatic Pacific willow trees represents a new strain belonging to the 16SrI group.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».