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Enregistrement W4413103676 · doi:10.1021/acscentsci.5c00804

An Assessment of Chemical Diversity in Microbial Natural Products

2025· review· en· W4413103676 sur OpenAlexafffund
Roger G. Linington

Notice bibliographique

RevueACS Central Science · 2025
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMicrobial Natural Products and Biosynthesis
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesNational Center for Complementary and Integrative HealthNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Institutes of HealthOffice of Dietary Supplements
Mots-clésNatural (archaeology)Diversity (politics)Biochemical engineeringData scienceComputer scienceComputational biologyBiologyEngineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Natural products continue to play important roles in biomedical, agricultural and ecological science. Yet despite ongoing advances in "omics" technologies, including genomics, transcriptomics, phenomics and metabolomics, there is still no clear consensus on the scope and scale of chemical diversity in the natural world. The evolution and maturation of chemical databases for natural products offer opportunities to explore this question from a range of different perspectives. This Outlook will use data from the Natural Products Atlas to examine rates of similarity and variation among biosynthetic classes of molecules, to explore how structure can be related to function, and to examine the scope and scale of new scaffold discovery in the current era of natural products science. It presents an examination of known chemical diversity, investigates what this diversity can tell us about potential translational applications, and explores how current knowledge informs what we might expect to discover in future studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,774
Score d'incertitude au seuil0,745

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,350
Écart entre enseignants0,322 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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