The pre-mRNA splicing factor ZOP1 contributes to the regulation of plant immunity
Notice bibliographique
Résumé
The Arabidopsis (Arabidopsis thaliana) receptor-like protein SUPPRESSOR OF NPR1-1, CONSTITUTIVE 2 (SNC2) confers basal resistance against pathogens. The transcription factor CALMODULIN-BINDING PROTEIN 60 g (CBP60g) and its homolog SYSTEMIC ACQUIRED RESISTANCE DEFICIENT 1 (SARD1) define two parallel pathways downstream of SNC2. Here, we report the identification and characterization of ZINC-FINGER AND OCRE DOMAIN-CONTAINING PROTEIN 1 (ZOP1), a pre-mRNA splicing factor that functions as a positive regulator of SNC2-mediated immunity. ZOP1 functions immediately downstream of SNC2 before the defense signals branch to CBP60g and SARD1. Loss-of-function mutation in ZOP1 suppresses snc2-1D-mediated autoimmunity, while zop1 single mutants exhibit compromised resistance against pathogens. RNA-sequencing analysis revealed that many defense response genes are differentially expressed or have altered splicing patterns in the zop1 mutant. The genes downregulated in the zop1 mutant include BDA1 and RLP23, which encode two key regulators of plant defense. Overall, our study suggests that ZOP1 contributes to the regulation of plant immunity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».