ITAF <sub>45</sub> is a pervasive <i>trans</i> -acting factor for picornavirus Type II IRES elements
Notice bibliographique
Résumé
Viruses have evolved elaborate mechanisms to hijack the host mRNA translation machinery to direct viral protein synthesis. Picornaviruses, whose RNA genome lacks a cap structure, inhibit cap-dependent mRNA translation, and utilize an internal ribosome entry site (IRES) in the RNA 5′ untranslated region to recruit the 40S ribosomal subunit. IRES activity is stimulated by a set of host proteins termed IRES trans -acting factors (ITAFs). The cellular protein ITAF 45 (also known as PA2G4 or EBP1) was documented as an essential ITAF for foot-and-mouth disease virus (FMDV), with no apparent role in cell-free systems for encephalomyocarditis virus (EMCV) and Theiler’s murine encephalomyelitis virus (TMEV), which are closely related viruses harboring similar IRES elements. Here, we demonstrate that ITAF 45 is a pervasive host factor for picornaviruses containing a Type II IRES. CRISPR/Cas9 knockout of ITAF 45 in several human cell lines conferred resistance to infection with FMDV, EMCV, TMEV, and equine rhinitis A virus (ERAV). We show that ITAF 45 enhances initiation of translation on Type II IRESs in cell line models. This is mediated by the C-terminal lysine-rich region of ITAF 45 known to enable binding to viral RNA. These findings challenge previous reports of a restricted role for ITAF 45 in FMDV infection, thus positioning ITAF 45 as a potential antiviral target for various animal viruses and emerging human cardioviruses.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».