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Enregistrement W4413108416 · doi:10.1016/j.jmb.2025.169381

Recurrent Acrodysostosis-Related PKA RIα Mutant Reveals a Novel Mechanism of Aberrant PKA Deactivation

2025· article· en· W4413108416 sur OpenAlexafffund
Leonardo Della Libera, Karla Martinez Pomier, Madoka Akimoto, Ganesh S. Anand, Susan S. Taylor, Giuseppe Melacini

Notice bibliographique

RevueJournal of Molecular Biology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Kinase Regulation and GTPase Signaling
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésAllosteric regulationProtein kinase AMutantMutationProtein subunitCell biologyChemistryGene isoformLigand (biochemistry)BiophysicsKinaseBiologyBiochemistryEnzymeReceptorGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Protein kinase A (PKA) is essential in converting extracellular signals into tightly regulated cellular responses controlling vital processes such as growth, development, and gene expression. Activation of PKA is controlled by the binding of cAMP to the regulatory subunit of PKA (R). Several mutations in the ubiquitous RIα isoform of R cause Acrodysostosis 1 (ACRO), a disease characterized by resistance to thyroid-stimulating and parathyroid hormones leading to severe congenital malformations. This work examines the recurrent R366X truncation ACRO mutant, which exhibits severe PKA hypoactivation due to loss of sensitivity to cAMP and the impairment of allosteric networks. The R366X RIα mutant has been previously studied via X-ray crystallography, but the crystal structure only captured the inhibited state and showed minimal difference from the wild type structure. Additionally, previous studies only examined the effects of ACRO mutants on the activation cycle of PKA (i.e. sensitivity to cAMP binding). Here we focus on the less understood signal termination cycle. We hypothesize that R366X acts by perturbing dynamic intermediates relevant to the PKA deactivation cycle, which are not fully recapitulated by static structures. To test our hypothesis, we combined low- and high-resolution approaches for probing protein-ligand binging, mutant stability, and identifying regions exhibiting aberrant allosteric behaviors. Based on our results, we propose a novel mechanism whereby R366X not only impairs physiological PKA activation but also accelerates PKA deactivation by increasing the rate of phosphodiesterase-catalyzed cAMP hydrolysis to 5'-AMP. Our studies shed new light on the current understanding of PKA dysregulation and ACRO's molecular etiology, outlining a multi-resolution experimental design which is transferable to other ACRO mutants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,197
Score d'incertitude au seuil0,660

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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