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Enregistrement W4413117138 · doi:10.1371/journal.pgen.1011542

Polymerization and flanking domains of the bactofilin BacA collectively regulate stalk formation in Asticcacaulis biprosthecum

2025· article· en· W4413117138 sur OpenAlexaff
Maxime Jacq, Paul D. Caccamo, Yves V. Brun

Notice bibliographique

RevuePLoS Genetics · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Genetics and Biotechnology
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Institutes of Health
Mots-clésBiologyStalk5' flanking regionGeneticsCell biologyEvolutionary biologyGenePromoterGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bactofilins are a recently discovered class of cytoskeletal protein, widely implicated in subcellular organization and morphogenesis in bacteria and archaea. Several lines of evidence suggest that bactofilins polymerize into filaments using a central β-helical core domain, flanked by variable N- and C- terminal domains that may be important for scaffolding and other functions. In Asticcacaulis biprosthecum, the bactofilin BacA serves as a topological organizer of stalk synthesis, localizing to the stalk base and coordinating the synthesis of these long, thin extensions of the cell envelope. The easily distinguishable phenotypes of wild-type A. biprosthecum stalks and ΔbacA "pseudostalks" make this an ideal system for investigating how mutations in BacA affect its functions in morphogenesis. Here, we redefine the core domain of A. biprosthecum BacA using various bioinformatics and biochemical approaches to precisely delimit the N- and C- terminal domains. We then show that loss of these terminal domains leads to cells with severe morphological abnormalities, typically presenting a pseudostalk phenotype. BacA mutants lacking the N- and C- terminal domains also exhibit localization defects, implying that the terminal domains of BacA may be involved in its subcellular positioning, possibly through regulatory interactions with membrane-associated factors or other morphological proteins. We further show that point mutations that render BacA defective for polymerization lead to stalk synthesis defects. Overall, our study suggests that BacA's polymerization capacity and domain-mediated cellular positioning play a crucial role in the protein's function as a morphogenic regulator.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,379

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,207
Écart entre enseignants0,202 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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