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Enregistrement W4413257235 · doi:10.1111/nph.70426

How evolution repeatedly builds complexity: a case study with <scp>C<sub>4</sub></scp> photosynthesis in <i>Blepharis</i> (Acanthaceae)

2025· article· en· W4413257235 sur OpenAlexafffund
Matt Stata, Ming‐Ju Amy Lyu, Hongbing Liu, Shifeng Cheng, Xin‐Guang Zhu, Tammy L. Sage, Rowan F. Sage

Notice bibliographique

RevueNew Phytologist · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Diversity and Evolution
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesBasic and Applied Basic Research Foundation of Guangdong ProvinceNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésAcanthaceaePhotosynthesisBotanyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary With over 60 parallel origins representing evolutionary replicates, C 4 photosynthesis is well‐suited for studying complex trait evolution. However, lineages with diverse C 3 –C 4 intermediate species are scarce, leaving uncertainty in models of C 4 evolution. Phenotypic characterization of 28 living species of Blepharis (Acanthaceae) is presented, including photosynthetic gas exchange, enzyme activity assays, cell ultrastructure, and δ 13 C assays, the latter including 92 herbarium specimens from three species with phenotypic diversity. A well‐resolved transcriptome‐based phylogeny provides evolutionary context. C 3 , proto‐Kranz, C 2 , C 4 ‐like, and C 4 phenotypes occur in Blepharis sect. Acanthodium . The phylogeny supports a stepwise progression from C 3 through C 2 to C 4 states and up to five distinct origins of the C 4 cycle. Substantial intraspecific C 2 –C 4 variation is demonstrated in Blepharis mitrata , Blepharis furcata , and Blepharis macra . Blepharis gazensis is a monospecific C 4 lineage exhibiting an NADP malic enzyme C 4 pathway with features of the NAD‐ME subtype, extending the ways in which the C 4 cycle is known to function. Substantial photosynthetic diversity exists in Blepharis that rivals or exceeds the range of character states present in other C 3 to C 4 transitional lineages. This diversity in Blepharis represents a robust new model for studying convergent evolution of C 4 photosynthesis and complex traits in general.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,127
Score d'incertitude au seuil0,992

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,191 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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